真菌の疫学、生態学、および予防
真菌の疫学、生態学、および予防は、真菌がどのように集団レベルで疾患を引き起こすかを研究する真菌学の分野である。すなわち、病原性真菌が環境のどこに生息しているのか、その分布が地域や宿主グループにおける真菌症の負担をどのように形成しているのか、人々がどのように感染を獲得するのか、そして曝露と疾患をどのように予防できるのかを研究する。この分野は、環境生物としての真菌の自然史と、ヒトおよび動物の疾患の測定された頻度を結びつけるものである。
Definition
真菌の疫学、生態学、および予防は、集団における真菌感染症の分布、環境貯蔵庫、伝播、および決定要因、ならびに曝露と疾患を減らすために使用される対策の研究である。
Scope
この分野は、真菌症の地理的分布と風土病性、真菌の環境生態学と感染が伝播する経路、リスクを高める職業的および環境的曝露、ならびに予防および曝露制御のための戦略という、4つの関連するテーマに読者を導く。これらは、真菌性疾患が集団においてどのように発生し、どのように数えられるかについての参照概要として構成されており、個人の診断や治療のガイドではない。
Sub-topics
Core questions
- 病原性真菌は環境のどこに生息し、その地理は誰が感染するかをどのように形成するのか？
- 吸入、接種、摂取、または接触といったどの経路で、人々は真菌感染症を獲得するのか？
- どの宿主、職業、および環境要因が真菌性疾患のリスクを高めるのか？
- 真菌性疾患の世界的な負担はどれくらい大きく、どの程度信頼性をもって測定されているのか？
- 脆弱なグループにおける真菌への曝露を減らし、感染を予防するための介入策は何か？
Key concepts
- 風土病性と環境貯蔵庫
- 腐生性対病原性真菌の生活様式
- 分生子と胞子の吸入が主要な曝露経路
- 日和見感染と宿主の免疫抑制
- 新興および抗真菌薬耐性病原体
- 世界的な負担の推定と症例の確定
- 一次予防と曝露制御
Mechanisms
医学的に重要な真菌のほとんどは、その生活環を完結するためにヒト宿主を必要としない環境腐生生物である。ヒトの疾患は通常、空気中の分生子、土壌、腐敗した植物、または汚染された表面への曝露の偶発的な結果である。したがって、疾患の地理は生物の生態を追跡する。土壌の水分、温度、および基質は、Histoplasmaのような二形性風土病真菌がどこに存続するかを決定し、Aspergillusのような遍在性のカビはほとんどどこにでも存在する。曝露が疾患につながるかどうかは宿主に大きく依存する。無傷の免疫はしばしば生物を封じ込めたり排除したりするが、免疫抑制、構造的肺疾患、またはバリア表面の破綻は進行を許容する。宿主感受性（HIV、移植、重症疾患）および真菌自体（新種の出現と抗真菌薬耐性）における集団レベルの変化は、観察される疫学を共同で推進する。
Clinical relevance
真菌がどこに生息し、どのように伝播し、誰がリスクにさらされているかを理解することは、臨床医や公衆衛生システムが真菌症を予測し、数え、予防する方法の基礎となる。この分野は、真菌性疾患が出現する集団の文脈と、予防がどのように構想されるかを記述する。これはその文脈のための参照資料であり、臨床評価や個別化されたケアの代わりとなるものではない。
Epidemiology
控えめな推定では、深刻な真菌性疾患の世界的な負担は年間数億件に上り、侵襲性および慢性真菌症はかなりの死亡率に寄与しており、免疫抑制された集団の拡大に伴い負担は増加している。分布は非常に不均一である。風土病性の二形性真菌症は特定の地理的地域に集中し、日和見性カビおよび酵母感染症は医療および免疫不全の環境でクラスターを形成し、Candida aurisやアゾール耐性Aspergillusのような新たに発生した生物は最近のサーベイランスを再構築した。
Evidence & guidelines
この分野の証拠は、サーベイランスプログラム、有病率および負担モデリング、環境サンプリング、ならびに米国感染症学会や欧州医真菌学会などの団体からの学会ガイドラインに由来する。これらのガイドラインは、疫学的および予防的考慮事項を臨床的推奨事項とともに組み込んでいる。
History
真菌がヒト疾患を引き起こす環境生物であるという認識は、20世紀を通じて成熟した。風土病性真菌症が特定の土壌や気候に関連付けられ、20世紀後半の免疫抑制の増加、特にHIVパンデミックと現代の移植が、日和見真菌症を主要な臨床問題に変えたためである。21世紀は新たな側面を加えた。抗真菌薬耐性およびこれまで知られていなかった病原体の世界的な出現であり、真菌の生態学、サーベイランス、および予防への新たな注目を促した。
Key figures
- David W. Denning
- Arturo Casadevall
- Matthew C. Fisher
- John R. Perfect
Related topics
Seminal works
- bongomin-2017
- fisher-2018
- kohler-2014
Frequently asked questions
- 人々は通常どのように真菌感染症にかかるのですか？
- ほとんどは他の人からではなく環境から獲得されます。これは、関与する真菌が環境生物であり、絶対的なヒト寄生虫ではないため、通常は空気中の胞子を吸入するか、土壌や植物材料が皮膚に接種されることによって起こります。
- 真菌性疾患の世界的な負担が過小評価されているとよく言われるのはなぜですか？
- 多くの環境で診断検査が限られており、真菌感染症は見過ごされやすいため、有病率と負担の数値はモデリングに大きく依存しており、控えめなものと広く見なされています。