ScholarGate
アシスタント
Process / pipelineBioinformatics / omics

ベイジアン微生物群集多様性解析 — コミュニティ構造の確率的評価

ベイジアン微生物群集多様性解析は、16S rRNAまたはショットガンメタゲノムカウントデータに対し、主にディリクレ・多項分布および関連する階層的フレームワークといった確率モデルを適用し、α多様性(サンプル内リッチネスと均等度)およびβ多様性(サンプル間組成差)を推定する。この際、推論チェーン全体を通じて不確実性を伝播させる。頻度論的、希少化(rarefaction)ベースのアプローチとは異なり、ベイジアン手法は分類群カウントを潜在的組成からのドローとして扱い、多様性指標に対する信頼区間(credible interval)および不均等なシーケンス深度を持つ群間の原理的な比較を可能にする。

MethodMindで開く近日公開動画近日公開スライドをダウンロード

手法の全文を読む

会員限定

無料アカウントでログインすると、このセクションを読めます。

ログイン

手法マップ

関連する手法の近傍 — ノードを選択して探索できます。

出典

  1. Holmes, I., Harris, K., & Quince, C. (2012). Dirichlet Multinomial Mixtures: Generative Models for Microbial Metagenomics. PLOS ONE, 7(2), e30126. link
  2. La Rosa, P. S., Brooks, J. P., Deych, E., Boone, E. L., Edwards, D. J., Wang, Q., Sodergren, E., Weinstock, G., & Shannon, W. D. (2012). Hypothesis Testing and Power Calculations for Taxonomic-Based Human Microbiome Data. PLOS ONE, 7(12), e52078. link

このページの引用方法

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis

どの手法を選ぶ?

この手法を最も近い類縁の手法と並べ、両者を見比べてください — ライブラリは本を机の上に並べるだけ。選ぶのはあなたです。

並べて比較する
ScholarGateBayesian Microbiome Diversity Analysis (Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity). 2026-06-15に以下より取得 https://scholargate.app/ja/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis · データセット: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026