Jednoćelijska filogenetska analiza — Rekonstrukcija stabla loze na rezoluciji pojedinačnih ćelija
Jednoćelijska filogenetska analiza rekonstruira evolucijska ili razvojna stabla iz podataka sekvenciranja pojedinačnih ćelija, prateći kako su se individualne ćelije razdvajale od zajedničkog pretka. Korištenjem somatskih mutacija, bar kodova uvedenih CRISPR-om ili promjena broja kopija kao nasljednih obilježja, ova metoda mapira klonske odnose unutar tumora, razvijajućih tkiva ili imunoloških repertoara s neviđenom ćelijskom rezolucijom.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Karta metoda
Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.
Izvori
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.
- Analiza varijacija broja kopijaBioinformatika↔ usporedi
- Filogenetička analizaBioinformatika↔ usporedi
- Analiza RNA-sekvencije pojedinačnih stanicaBioinformatika↔ usporedi
- Pozivanje varijantiBioinformatika↔ usporedi
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →