Épidémiologie et transmission virales
L'épidémiologie et la transmission virales constituent l'étude de la manière dont les infections virales apparaissent, se propagent et se maintiennent au sein et entre les populations hôtes. Elle relie la biologie du déplacement des virus individuels d'un hôte à l'autre aux schémas au niveau de la population que ces mouvements produisent, des infections sporadiques aux épidémies et pandémies, et fournit les concepts quantitatifs utilisés pour décrire et comparer la propagation des maladies virales.
Definition
L'épidémiologie et la transmission virales sont la branche de l'épidémiologie et de la virologie qui s'intéresse à la distribution, aux déterminants et à la dynamique des infections virales dans les populations, ainsi qu'aux mécanismes par lesquels les virus sont transmis entre les hôtes.
Scope
Ce domaine regroupe les concepts fondamentaux qui décrivent la propagation virale à l'échelle de la population : les voies par lesquelles les virus se déplacent entre les hôtes, le moment de l'infectiosité par rapport aux symptômes, les paramètres récapitulatifs qui quantifient la transmissibilité, tels que le nombre de reproduction de base et le taux d'attaque, le rôle de la structure de la population et de l'immunité accumulée, ainsi que la dynamique des épidémies et des pandémies. Il les présente comme des concepts de référence en virologie et en épidémiologie des maladies infectieuses et ne fournit pas de prescriptions cliniques ou de santé publique.
Sub-topics
Core questions
- Par quelles voies un virus donné se déplace-t-il d'un hôte à l'autre ?
- À quel moment de l'infection un hôte est-il capable de transmettre le virus, et pendant combien de temps ?
- Quelle est la transmissibilité d'un virus, et comment cette transmissibilité est-elle résumée quantitativement ?
- Comment la structure de la population et l'immunité accumulée influencent-elles la croissance ou la disparition d'une épidémie ?
- Qu'est-ce qui distingue la dynamique d'une épidémie de celle d'une pandémie ?
Key concepts
- Voies de transmission virale
- Période infectieuse et période d'incubation
- Nombre de reproduction de base (R0) et nombre de reproduction effectif (Rt)
- Taux d'attaque et taux d'attaque secondaire
- Immunité collective et seuil d'immunité collective
- Dynamique des épidémies et des pandémies
- Cadre Susceptible-Infecté-Rétabli (compartimental)
Mechanisms
La propagation virale au niveau de la population découle d'une chaîne d'événements de transmission individuels. Un virus est libéré d'un hôte infecté (par exemple, dans les gouttelettes respiratoires, les aérosols, les fluides corporels ou les fèces), survit dans ou sur un milieu pendant un certain intervalle, et atteint un hôte sensible par une voie compatible. Le fait que de tels événements s'accumulent en une propagation soutenue dépend du nombre moyen d'infections secondaires que chaque cas produit, ce qui est capturé par le nombre de reproduction, qui à son tour reflète la transmissibilité du virus, la durée et le moment de l'infectiosité, et le nombre de contacts sensibles disponibles. À mesure que l'infection ou la vaccination épuise le réservoir de personnes sensibles, le nombre de reproduction effectif diminue, ralentissant et finalement inversant la croissance.
Clinical relevance
Les concepts de ce domaine sous-tendent la manière dont les épidémies de maladies virales sont détectées, décrites et comparées, et ils éclairent le raisonnement derrière les stratégies de surveillance, non pharmaceutiques et d'immunisation. Ils sont présentés ici pour expliquer comment la propagation virale est caractérisée au niveau de la population ; ils décrivent le raisonnement épidémiologique plutôt que les décisions individuelles de diagnostic ou de traitement.
Epidemiology
Les infections virales vont des conditions endémiques qui circulent continuellement aux épidémies explosives et aux pandémies mondiales. Les virus respiratoires tels que la grippe et le SARS-CoV-2 illustrent l'étendue de la transmissibilité et l'importance de l'infectiosité pré-symptomatique, tandis que l'étude comparative des nombres de reproduction et des taux d'attaque entre les agents pathogènes fournit un cadre commun pour comprendre pourquoi certains virus se propagent beaucoup plus facilement que d'autres.
History
L'étude quantitative de la propagation des maladies infectieuses a émergé des modèles mathématiques du début du XXe siècle et s'est développée au cours de la seconde moitié du siècle à mesure que les modèles compartimentaux et le cadre du nombre de reproduction étaient développés et appliqués. La synthèse de 1991 d'Anderson et May a consolidé l'approche de la dynamique des populations, et les épidémies et pandémies successives, y compris celles de la grippe et du SARS-CoV-2, ont testé et affiné ces outils à plusieurs reprises.
Key figures
- Roy Anderson
- Robert May
- Paul Fine
Related topics
Seminal works
- anderson-may-1991
- fine-1993
Frequently asked questions
- En quoi l'épidémiologie virale diffère-t-elle de la virologie ?
- La virologie étudie la biologie des virus et leur interaction avec les hôtes individuels, tandis que l'épidémiologie virale étudie comment les infections virales sont distribuées et se propagent au sein des populations ; les deux se rejoignent dans l'étude de la transmission, qui relie l'infectiosité individuelle aux schémas au niveau de la population.
- Quel est le chiffre unique qui résume le mieux la propagation d'un virus ?
- Aucun chiffre unique ne capture tout, mais le nombre de reproduction de base (R0) est le résumé le plus largement utilisé de la transmissibilité intrinsèque ; il est complété par le nombre de reproduction effectif, le taux d'attaque, et les descriptions de la voie et du moment de la transmission.