Distribution géographique et endémicité des mycoses

La distribution géographique et l'endémicité des mycoses décrivent comment les champignons pathogènes — et les maladies qu'ils provoquent — sont concentrés dans des régions, des climats et des sols particuliers. Plusieurs des pathogènes fongiques les plus importants sont des champignons dimorphes endémiques confinés à des zones géographiques définies, de sorte que la connaissance du lieu de vie ou de voyage d'un patient est essentielle pour comprendre les maladies auxquelles il a pu être exposé.

Definition

L'endémicité des mycoses fait référence à la présence persistante d'un agent pathogène fongique au sein d'une zone géographique définie, où les conditions environnementales permettent à l'organisme de survivre dans un réservoir et d'exposer la population locale à un taux de base relativement constant.

Scope

Ce sujet couvre le concept d'endémicité pour les maladies fongiques, les mycoses dimorphes endémiques classiques et leurs aires de répartition géographique, les raisons écologiques pour lesquelles les champignons sont liés à des environnements spécifiques, et comment les distributions évoluent avec le climat, les voyages et une meilleure reconnaissance. Il s'agit d'une référence épidémiologique et écologique, et non d'une base pour le diagnostic ou le traitement.

Core questions

• Quels champignons sont géographiquement endémiques et quelles sont leurs aires de répartition reconnues ?
• Quelles conditions environnementales confinent un champignon endémique à sa zone ?
• Comment l'historique de résidence ou de voyage influence-t-il l'exposition aux mycoses endémiques ?
• Les frontières des mycoses endémiques sont-elles stables ou sont-elles en expansion ?

Key concepts

• Endémicité et réservoir environnemental
• Champignons dimorphes (moisissure dans le sol, levure dans les tissus)
• Histoplasmose et sols des vallées fluviales
• Coccidioïdomycose et sols des zones arides
• Blastomycose, paracoccidioïdomycose et talaromycose
• Mycoses associées aux voyages et importées
• Expansion de l'aire de répartition sous l'effet du changement climatique

Mechanisms

Les champignons dimorphes endémiques existent sous forme de moisissures dans des sols particuliers et sous forme de levures (ou de sphérules) à la température corporelle, et leur confinement géographique reflète les conditions environnementales étroites que leur phase tellurique exige. Histoplasma capsulatum prospère dans les sols riches en azote, enrichis par les déjections d'oiseaux et de chauves-souris, classiquement dans les vallées fluviales ; Coccidioides occupe les sols arides et semi-arides où ses arthroconidies sont transportées par la poussière ; Blastomyces privilégie les environnements riverains humides et boisés ; Paracoccidioides et Talaromyces marneffei ont leurs propres aires de répartition restreintes respectivement en Amérique latine et en Asie du Sud-Est. Étant donné que l'exposition suit l'écologie de l'organisme, la distribution de la maladie correspond à la distribution du réservoir, avec des cas sporadiques apparaissant ailleurs suite à des voyages.

Clinical relevance

La connaissance des aires d'endémie des agents pathogènes fongiques explique pourquoi l'historique géographique et de voyage d'une personne fait partie du tableau épidémiologique des maladies fongiques, et pourquoi les infections peuvent apparaître loin de leur lieu d'acquisition. Cette entrée décrit ces schémas de distribution comme matériel de référence et ne dicte pas le diagnostic ou la prise en charge individuelle.

Epidemiology

Les mycoses endémiques causent un grand nombre d'infections au sein de leurs zones — la coccidioïdomycose dans le sud-ouest des États-Unis et certaines parties de l'Amérique latine, l'histoplasmose à travers les Amériques et au-delà, la talaromycose parmi les populations affectées par le VIH en Asie du Sud-Est — pourtant, de nombreuses infections sont subcliniques, de sorte que les nombres de cas rapportés sous-estiment considérablement l'exposition réelle. Les estimations de la charge mondiale soulignent que les distributions sont plus larges et plus dynamiques que ce qui était historiquement cartographié, avec une expansion documentée et suspectée de plusieurs aires d'endémie.

Evidence & guidelines

Les lignes directrices des sociétés savantes pour les mycoses endémiques, telles que la ligne directrice de l'IDSA sur la coccidioïdomycose, intègrent l'épidémiologie géographique de ces infections, et les revues d'estimation de la charge synthétisent la prévalence dans les régions endémiques.

History

Le lien entre des champignons spécifiques et des lieux spécifiques a été établi grâce à des travaux de terrain et de laboratoire du XXe siècle qui ont relié l'histoplasmose à des sols particuliers et la coccidioïdomycose à la poussière aride, donnant naissance au concept de mycoses endémiques. À mesure que les voyages augmentaient et que les populations immunodéprimées croissaient, les cas importés et réactivés ont attiré l'attention sur la distance à laquelle la maladie pouvait apparaître du réservoir, et les dernières décennies ont apporté des preuves que les frontières endémiques ne sont pas fixes.

Debates

Les frontières des mycoses endémiques sont-elles en expansion ?

Des rapports d'histoplasmose et de coccidioïdomycose en dehors de leurs zones historiquement cartographiées soulèvent la question de savoir si les aires de répartition sont réellement en expansion — en raison du changement climatique et de l'utilisation des terres — ou simplement mieux reconnues ; distinguer les deux est méthodologiquement difficile.

Key figures

• Carol A. Kauffman
• John N. Galgiani
• David W. Denning

Seminal works

• kauffman-2007
• galgiani-2016

Frequently asked questions

Qu'est-ce qui rend une maladie fongique « endémique » à une région ?

Le champignon responsable persiste dans un réservoir environnemental local — généralement un sol et un climat particuliers — de sorte que les résidents et les visiteurs y sont exposés à un taux de fond relativement stable.

Une personne peut-elle développer une mycose endémique loin de l'endroit où elle est présente ?

Oui ; l'exposition se produit dans la zone endémique, mais l'infection peut se manifester plus tard et ailleurs, c'est pourquoi l'historique de voyage et de résidence fait partie du tableau épidémiologique.