Process / pipelineBioinformatics / omics

تحلیل بیزی تنوع میکروبیوم — ارزیابی احتمالی ساختار جامعه

تحلیل بیزی تنوع میکروبیوم، مدل‌های احتمالی — عمدتاً چارچوب‌های سلسله مراتبی و مرتبط با دیریکله-چندجمله‌ای — را بر روی داده‌های شمارش 16S rRNA یا متاژنومیک شات‌گان به کار می‌برد تا آلفا-تنوع (غنا و یکنواختی درون نمونه‌ای) و بتا-تنوع (تفاوت‌های ترکیبی بین نمونه‌ای) را تخمین بزند، در حالی که عدم قطعیت را در کل زنجیره استنتاج منتشر می‌کند. برخلاف رویکردهای فراوانی مبتنی بر کمیابی، روش‌های بیزی شمارش‌های تاکسون را به عنوان نمونه‌هایی از یک ترکیب پنهان در نظر می‌گیرند و امکان فواصل اطمینان برای معیارهای تنوع و مقایسه اصولی در میان گروه‌هایی با عمق توالی‌دهی نابرابر را فراهم می‌کنند.

باز کردن در MethodMindبه‌زودیویدیوبه‌زودیDownload slides

مطالعهٔ کامل روش

ویژهٔ اعضا

برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.

ورود

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

منابع

  1. Holmes, I., Harris, K., & Quince, C. (2012). Dirichlet Multinomial Mixtures: Generative Models for Microbial Metagenomics. PLOS ONE, 7(2), e30126. link
  2. La Rosa, P. S., Brooks, J. P., Deych, E., Boone, E. L., Edwards, D. J., Wang, Q., Sodergren, E., Weinstock, G., & Shannon, W. D. (2012). Hypothesis Testing and Power Calculations for Taxonomic-Based Human Microbiome Data. PLOS ONE, 7(12), e52078. link

نحوهٔ استناد به این صفحه

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateBayesian Microbiome Diversity Analysis (Bayesian Statistical Analysis of Microbiome Diversity). بازیابی‌شده در 2026-06-15 از https://scholargate.app/fa/bioinformatics/bayesian-microbiome-diversity-analysis · مجموعه‌داده: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026