Anàlisi d'enriquiment de conjunts de gens basat en xarxes
L'anàlisi d'enriquiment de conjunts de gens basat en xarxes (network GSEA) estén la GSEA clàssica incorporant xarxes d'interacció biològica —com ara grafs d'interacció proteïna-proteïna (PPI) o de coexpressió— a la prova d'enriquiment. En lloc de tractar cada gen de forma independent, el mètode propaga senyals de canvis d'expressió a través de les arestes de la xarxa, permetent que els gens co-regulats o funcionalment connectats donin suport conjunt a la significació d'un conjunt de gens. El resultat és una puntuació d'enriquiment biològicament coherent que té en compte la topologia de la via i les dependències gen-gen.
Llegeix el mètode complet
Inicia la sessió amb un compte gratuït per llegir aquesta secció.
Mapa de mètodes
El veïnat de mètodes relacionats — seleccioneu un node per explorar-lo.
Fonts
- Shojaie, A., & Michailidis, G. (2010). Network enrichment analysis in complex experiments. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 9(1), Article 22. link ↗
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. link ↗
Com citar aquesta pàgina
ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/ca/bioinformatics/network-based-gene-set-enrichment-analysis
Quin mètode?
Poseu aquest mètode al costat dels seus parents més pròxims i llegiu-los de costat a costat — la biblioteca disposa els llibres sobre la taula; la tria és vostra.
- Anàlisi d'Enriquiment de Conjunts de Gens (GSEA)Bioinformàtica↔ compara
- GWAS basat en xarxesBioinformàtica↔ compara
- Anàlisi d'Enriquiment de ViesBioinformàtica↔ compara
- Expressió Diferencial en RNA-seqBioinformàtica↔ compara
- Single-cell Gene Set Enrichment AnalysisBioinformàtica↔ compara
Citat per
Has vist cap problema en aquesta pàgina? Informa'n o suggereix una correcció →