Скорост на РНК
Скоростта на РНК е изчислителен метод, който определя бъдещото развитие на отделни клетки от данни от едноклетъчно РНК-секвениране. Разработен от La Manno и колеги през 2018 г., анализът на скоростта на РНК измерва посоката и темпа на преходите на клетъчното състояние чрез анализ на съотношението на неспоени към споени иРНК транскрипти в отделни клетки. Това позволява прогнозиране на клетъчните траектории и пътища на диференциация без необходимост от времево вземане на проби или манипулация, предоставяйки уникални прозрения за решенията за клетъчната съдба по време на развитието и заболяванията.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Карта на методите
Обкръжението на сродните методи — изберете възел, за да го разгледате.
Източници
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/genetics/rna-velocity
Кой метод?
Поставете този метод до най-близките му сродни методи и ги четете едно до друго — библиотеката полага книгите на масата; изборът е ваш.
- ATAC-seq анализГенетика↔ сравняване
- Анализ на Hi-CГенетика↔ сравняване
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →