تحيز التمثيل في أبحاث علم الجينوم الدوائي

تحيز التمثيل هو الإفراط المنهجي في تمثيل بعض المجموعات السكانية - وبشكل طاغٍ الأشخاص من أصول أوروبية - والنقص في تمثيل مجموعات سكانية أخرى في المجموعات البحثية وقواعد البيانات المرجعية ودراسات التحقق التي يقوم عليها علم الجينوم الدوائي. نظرًا لأن اكتشاف الجينات الدوائية وتدوينها تتم معايرتهما وفقًا للمجموعات السكانية المدروسة، فإن هذا الخلل يجعل القاعدة البيّنة أقل اكتمالًا وأقل موثوقية للمجموعات غير الممثلة بشكل كافٍ.

Definition

الانحراف المنهجي في الأدلة الجينومية الدوائية حيث تقوم مجموعات الاكتشاف، واللوحات المرجعية، ودراسات التحقق بأخذ عينات غير متناسبة من مجموعات سكانية معينة - بشكل رئيسي من أصول أوروبية - مما ينتج عنه نتائج وأدوات لا يمكن تعميمها بشكل متساوٍ عبر البشرية.

Scope

يوثق هذا الموضوع حجم فجوة التنوع في أبحاث الجينوم والجينوم الدوائي، والآليات التي من خلالها يؤثر هذا التحيز على النتائج، وعواقبه اللاحقة على العدالة. إنه نظرة عامة منهجية ومرجعية؛ ولا يقدم أي توصيات سريرية.

Core questions

• ما مدى عدم التساوي في تمثيل المجموعات السكانية في أبحاث الجينوم والجينوم الدوائي؟
• من خلال أي آليات يؤثر نقص التمثيل على الاكتشاف والتدوين والتحقق؟
• ما هي عواقب فجوة التنوع على العدالة؟
• ما هي المبادرات التي تعمل على توسيع تنوع البيانات الجينومية؟
• كيف يتفاعل تحيز التمثيل مع قابلية نقل التنبؤات الجينية؟

Key concepts

• الإفراط في التمثيل والنقص في التمثيل
• تحيز التحديد
• تركيب اللوحة المرجعية
• قابلية نقل (قابلية حمل) التنبؤات
• تفسير المتغيرات وإعادة تصنيفها
• البنوك الحيوية والاتحادات المتنوعة (مثل TOPMed، H3Africa، All of Us)
• الفوارق الصحية

Mechanisms

يدخل التحيز في عدة مراحل. فالمجموعات البحثية للاكتشاف التي تُجمع بشكل رئيسي من المشاركين ذوي الأصول الأوروبية تحدد المتغيرات الشائعة في تلك المجموعة، لذا فإن المتغيرات المنتشرة في أماكن أخرى تكون أقل عرضة للاكتشاف أو التدوين الوظيفي. واللوحات المرجعية المجمعة من بيانات منحازة تستنتج وتفسر التباين بشكل أفضل للمجموعات السكانية الممثلة جيدًا. وتؤكد دراسات التحقق التي تُجرى في نفس المجموعات الأداء هناك ولكنها تترك قابلية التعميم غير مختبرة في أماكن أخرى. ونتيجة لذلك، تميل التنبؤات الجينية - بما في ذلك الدرجات متعددة الجينات - إلى الانتقال بشكل سيء إلى المجموعات السكانية غير الممثلة بشكل كافٍ، وغالبًا ما تُصنف المتغيرات في تلك المجموعات السكانية على أنها ذات أهمية غير مؤكدة. وتتأثر المجموعات السكانية الأفريقية، التي تحتوي على أكبر قدر من التنوع الجيني، بشكل خاص لأن الكثير من تباينها غائب ببساطة عن الموارد التي تركز على أوروبا.

Clinical relevance

يُعد تحيز التمثيل أمرًا أساسيًا للحكم على ما إذا كانت نتيجة أو أداة جينومية دوائية موثوقة لمجموعة سكانية معينة. يصف هذا المدخل كيفية نشوء التحيز وما يترتب عليه من آثار على اكتمال الأدلة؛ وهو ليس إرشادًا سريريًا ولا يتناول الاختبار أو العلاج للأفراد.

Epidemiology

لقد وجدت مراجعات دراسات الارتباط على مستوى الجينوم والدراسات الجينومية مرارًا وتكرارًا أن المشاركين من أصول أوروبية يشكلون غالبية كبيرة من الذين تمت دراستهم - وهو ما يتجاوز بكثير حصتهم من سكان العالم - بينما تظل المجموعات السكانية الأفريقية، وأمريكا اللاتينية، والعديد من المجموعات الآسيوية والسكان الأصليين ممثلة تمثيلاً ناقصًا بشكل ملحوظ، وهي فجوة لم تضيق إلا ببطء على الرغم من الاهتمام المستمر.

History

تجسد القلق بشأن نقص التنوع في علم الجينوم من خلال تحليل بوبجوي وفولرتون لعام 2016 الذي أظهر هيمنة المشاركين من أصول أوروبية، وعززه مراجعة سيروجو وزملاؤه لعام 2019 التي وثقت استمرار الفجوة. أظهر مارتن وزملاؤه (2019) ضررًا ملموسًا - أداءً أضعف وربما يزيد من التفاوت في الدرجات متعددة الجينات في المجموعات السكانية غير الأوروبية. ظهرت مبادرات مثل برنامج NHLBI TOPMed، و H3Africa، والبنوك الحيوية الكبيرة المتنوعة جزئيًا لمعالجة هذا الخلل.

Debates

لماذا استمرت فجوة التنوع على الرغم من الاهتمام؟

تشمل التفسيرات البنية التحتية الراسخة للتوظيف، وأنماط التمويل، وعدم الثقة التاريخي بين المجتمعات المهمشة، والملاءمة المنهجية؛ ويختلف المعلقون حول أي الروافع تسد الفجوة بفعالية أكبر.

Key figures

• Alice B. Popejoy
• Stephanie M. Fullerton
• Sarah Tishkoff
• Alicia R. Martin
• Charles Rotimi

Seminal works

• popejoy-2016
• sirugo-2019
• martin-2019

Frequently asked questions

لماذا يهم أن معظم الأبحاث الجينومية تجرى على المجموعات السكانية ذات الأصول الأوروبية؟

يتم معايرة اكتشاف الجينات الدوائية، وتفسير المتغيرات، والأدوات التنبؤية وفقًا للمجموعات السكانية المدروسة. عندما تكون هذه المجموعات في الغالب من أصول أوروبية، تكون المعرفة الناتجة أقل اكتمالًا وأقل موثوقية للمجموعات السكانية الأخرى، مما يساهم في الفوارق الصحية.

هل إضافة بيانات متنوعة يحل المشكلة؟

توسيع تنوع المجموعات البحثية واللوحات المرجعية ضروري ويساعد، ولكن يجب أن يقترن ذلك بأساليب تحليلية تنتقل عبر المجموعات السكانية ومع الاهتمام بثقة المجتمع والمنفعة العادلة.