遗传密码
将核苷酸的每个三字母密码子映射到氨基酸或终止信号的规则手册,以及破解它的实验。
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Definition
遗传密码是信使RNA的64个核苷酸三联体(密码子)与20种标准氨基酸以及翻译终止信号之间的一一对应关系,以固定的阅读框读取以指定蛋白质的序列。
Scope
本主题涵盖遗传密码的结构和特性:其三联体、不重叠、无逗号的读取方式;密码子-氨基酸的分配,包括起始和终止密码子;简并性和摆动(wobble);阅读框;以及密码子的近乎普遍性及其已知例外。它处理的是密码子本身;读取它的机制在关于核糖体和tRNA的相关主题中有所涵盖。
Core questions
- 如何确定密码子是以不重叠的三联体形式读取的?
- 如何将单个密码子分配给氨基酸?
- 为什么密码子比氨基酸多,以及什么是摆动(wobble)?
- 密码子的普遍性如何,存在哪些例外?
Key theories
- 三联体、不重叠密码子
- 遗传信息以连续的三个核苷酸组读取,不重叠,因此确定的阅读框决定了哪些密码子被读取;移码会打乱下游的信息。
- 简并性和摆动(wobble)
- 大多数氨基酸由几个同义密码子编码,这些密码子通常共享前两个位置,并且在密码子第三位点的灵活配对(摆动)使得单个tRNA可以读取多个密码子。
Mechanisms
该密码通过在无细胞系统中翻译合成RNA来解码:聚(U)模板指导聚苯丙氨酸的合成,将UUU分配给苯丙氨酸,并通过系统使用明确的聚合物和三联体来分配其余的密码子。这64个密码子包括61个指定氨基酸的有义密码子和3个终止密码子;一个起始密码子也设定了阅读框。简并性使得同义密码子集中,因此第三位点的变化通常是沉默的,而摆动配对(wobble pairing)则节省了所需tRNA的数量。
Clinical relevance
由于阅读框和密码子身份决定蛋白质序列,点突变、无义突变和移码突变对蛋白质产物具有可预测的后果,并构成了许多遗传疾病的基础;此处作为意义呈现,而非临床指导。
History
尼伦伯格(Nirenberg)和马泰(Matthaei)于1961年的聚(U)实验首次确定了密码子;科拉纳(Khorana)的明确聚合物、霍利(Holley)的tRNA测序以及克里克(Crick)的接头和摆动假说完善了密码子,并因此获得了1968年诺贝尔生理学或医学奖。
Key figures
- Marshall Nirenberg
- Har Gobind Khorana
- Francis Crick
- Robert Holley
Related topics
Seminal works
- nirenberg1961
- watson2013
Frequently asked questions
- 有多少个密码子,它们编码什么?
- 共有64个密码子:61个指定氨基酸,3个是终止信号;其中一个密码子也作为通常的起始密码子,设定阅读框。
- 什么是摆动(wobble)?
- 在密码子第三位点发生的灵活碱基配对,使得一个转运RNA能够识别多个同义密码子,从而减少细胞所需的tRNA数量。