核酶和催化RNA
作为酶的RNA分子——从自剪接内含子到核糖体——以及它们的存在对生命起源的意义。
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Definition
核酶是催化特定生化反应的RNA分子;催化RNA是基于RNA催化的更广泛现象,其中折叠的RNA活性位点(而非蛋白质)加速了诸如RNA裂解、连接或肽键形成等反应。
Scope
本主题涵盖RNA催化反应及其执行分子:自剪接I类和II类内含子、RNase P的RNA组分、小型自裂解核酶,以及作为天然核酶主要例子的核糖体。它探讨了折叠的RNA活性位点如何实现催化作用,以及催化RNA对RNA世界假说的影响。RNA结构的一般生物学内容在相关主题中介绍。
Core questions
- RNA分子如何催化化学反应?
- 天然核酶能进行哪些类型的反应?
- 为什么核糖体被认为是核酶?
- 催化RNA对生命早期进化有何启示?
Key theories
- RNA可以是酶
- Cech证明四膜虫内含子无需蛋白质即可自行切除,这确立了RNA可以折叠成活性位点并催化反应,推翻了所有酶都是蛋白质的假设。
- RNA世界假说
- 由于RNA既能储存信息又能催化反应,包括核糖体中的肽键形成,因此催化RNA支持了RNA代谢先于DNA和蛋白质酶存在的假说。
Mechanisms
核酶折叠成精确的三级结构,定位反应基团并通常协调金属离子以稳定过渡态,这与蛋白质酶的作用非常相似。自剪接内含子通过转酯化反应催化自身的切除;RNase P的RNA亚基裂解前体转移RNA;小型自裂解核酶切断自身的骨架;核糖体的RNA催化肽键形成。在每种情况下,催化能力都存在于折叠的RNA本身中,有时由相关蛋白质辅助。
Clinical relevance
工程化核酶和核糖体的核酶性质为RNA靶向研究工具和抗生素作用提供了信息;此处仅为意义阐述,不作为临床指导。
History
Cech于1982年报道的自剪接RNA和Altman同期关于RNase P催化RNA的研究确立了催化RNA的存在,并因此获得了1989年诺贝尔化学奖;后来显示核糖体是核酶的结构研究巩固了RNA的催化重要性。
Key figures
- Thomas Cech
- Sidney Altman
- Harry Noller
Related topics
Seminal works
- kruger1982
- watson2013
Frequently asked questions
- 什么是核酶?
- 一种作为酶的RNA分子,利用其折叠结构催化化学反应,例如切割或连接RNA。
- 催化RNA对生命起源为何重要?
- 它表明一种分子既可以携带信息又可以催化反应,使得在DNA和蛋白质出现之前,基于RNA的早期生命成为可能。