植物系统发育与分类
重建植物生命之树并将其转化为可行的分类是系统学的核心任务，目前主要由分子数据和被子植物系统发育群（Angiosperm Phylogeny Group）的共识分类所驱动。
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Definition
植物系统发育是推断出的植物谱系的进化历史和关系，而分类则是将植物组织成有名称、有等级的群组，旨在反映这种历史。
Scope
本主题涵盖推断植物系统发育的原理和方法、单系分类的目标、植物命名规则以及现代基于系统发育的分类系统（如APG）的结构。
Core questions
- 如何从形态学和分子数据推断植物系统发育？
- 为什么现在的分类是围绕单系群构建的？
- 命名规则如何管理植物分类单元的命名？
Key theories
- 单系性作为分类的基础
- 合理的分类只识别单系群——即包含一个祖先及其所有后代的群组——从而使命名的分类单元与真实的进化谱系相对应。
- 分子系统发育学
- 通过明确的建树方法分析DNA序列数据已成为植物关系的主要证据，这通常会推翻基于整体形态相似性的分类。
Clinical relevance
一个稳定、基于系统发育且名称一致的分类是农业、生药学、保护和贸易不可或缺的参考框架，它能可靠地识别农作物、药用植物、杂草和受保护物种。
History
林奈的等级和二项式命名法为植物命名提供了持久的框架；20世纪后期，亨尼格的支序分类学方法和分子数据的兴起重塑了植物分类，产生了连续的APG系统。
Key figures
- Willi Hennig
- Carl Linnaeus
- Mark W. Chase
Related topics
Seminal works
- judd2016
- apg2016
Frequently asked questions
- 什么是单系群？
- 单系群，或称演化支，由一个祖先谱系及其所有后代组成；现代分类旨在只命名此类群组，以便分类单元能反映真实的进化单位。
- 什么是APG分类？
- 被子植物系统发育群（APG）分类是一个被广泛采用并定期更新的系统，它根据分子系统发育证据而非整体相似性来排列开花植物的目和科。