考古遗传学与古代生物分子
考古遗传学和古代生物分子分析从人类和考古遗骸中获取遗传、蛋白质及其他分子证据，正在改变生物考古学中对过去人口历史、亲缘关系、疾病和饮食的研究。
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Definition
生物考古学的一个分支，分析来自考古学上的人类、动物和病原体遗骸中保存下来的生物分子——主要是DNA，但也包括蛋白质和脂质——以研究过去的遗传和分子维度。
Scope
该领域涵盖降解生物分子（尤其是古代DNA，以及古代蛋白质和其他残留物）的提取、测序和鉴定，以及利用它们重建人类迁徙、亲缘关系、表型、病原体和生存方式。它解决了处理受损、受污染分子的技术难题，以及破坏性采样人类遗骸所引发的伦理问题。
Sub-topics
Core questions
- 降解、受污染的古代生物分子如何才能被回收和鉴定？
- 古代基因组揭示了哪些关于迁徙、混合和人口历史的信息？
- 如何识别过去的病原体并追踪其演变？
- 当DNA未能保存下来时，蛋白质能提供哪些信息？
Key theories
- 古代生物分子的鉴定
- 一套用于区分真实古代DNA与现代污染的判别标准框架——包括特征性损伤模式、污染控制和重复性——对该领域的信誉至关重要。
- 人口历史的基因组重建
- 利用全基因组古代DNA来检测过去在考古学和骨骼数据中单独不可见或模糊的迁徙、混合事件和人口更替。
History
古代DNA研究始于20世纪80年代，最初的线粒体研究往往难以重现。20世纪90年代和21世纪初，严格的鉴定标准对其进行了改革。2010年左右高通量测序的出现使得基因组规模的研究成为可能，包括尼安德特人和丹尼索瓦人基因组的测序，并推动了考古遗传学、古病原体基因组学和古蛋白质组学的迅速发展，这项工作获得了斯万特·佩博（Svante Pääbo）2022年诺贝尔奖的认可。
Debates
- 古代基因组迁徙叙事的伦理与解读
- 关于破坏性采样和社区同意的争论，以及基于基因组的大规模迁徙和人口替代故事可能过度简化或本质化身份，并重新引入有问题的祖先观念的风险。
Key figures
- Svante Pääbo
- David Reich
- Ludovic Orlando
- Christina Warinner
Related topics
Seminal works
- paaboetal2004
- reich2018
- orlandoetal2021
Frequently asked questions
- 为什么古代DNA如此难以处理？
- DNA在死亡后会分解成短的、化学受损的片段，并且很容易被现代污染淹没，因此回收和鉴定真实的古代序列需要洁净实验室条件和专门的方法。
- 古代DNA能告诉我们哪些骨骼无法提供的信息？
- 它可以揭示生物亲缘关系、遗传祖先和迁徙、性别、某些身体特征以及特定病原体的存在——这些信息在骨骼本身中往往是不可见的。