古代DNA与生物分子考古学

古代DNA分析从考古和化石遗骸中恢复遗传物质，改变了对过去人类迁徙、亲缘关系、驯化和疾病的研究。

Definition

研究考古遗迹中保存的遗传和其他生物分子材料，用于重建过去人类、动物、植物和病原体的祖先、关系和生物学。

Scope

本主题涵盖从骨骼、牙齿、沉积物和其他遗骸中回收、鉴定和测序降解DNA，以及相关的生物分子证据，如古代蛋白质。它涉及古基因组学的方法、排除污染所需的严格控制，以及在人口历史、大陆定居、动植物驯化和古代病原体方面的应用。

Core questions

• 降解的古代DNA是如何被回收和鉴定的？
• 考古遗传学揭示了哪些关于过去迁徙和祖先的信息？
• 古代DNA如何用于研究驯化和疾病？
• 如何区分污染和损伤与真正的古代序列？

Key theories

人口历史的古基因组学

利用全基因组古代DNA检测过去的人口流动、混合和替代，重塑了史前迁徙模型，例如欧洲的定居。

古代DNA的鉴定

认识到真正的古代DNA是短的、化学损伤的，并且容易被现代污染淹没，需要严格的实验室控制和损伤模式标准来验证结果。

History

古代DNA研究始于20世纪80年代，首次从博物馆标本中获得了序列，但早期关于非常古老DNA的说法因污染而被证明不可靠。该领域在严格的鉴定基础上重建，随后通过高通量测序得到变革，使得尼安德特人基因组和大规模古基因组学研究成为可能，这项工作因斯万特·帕博（Svante Pääbo）获得2022年诺贝尔奖而得到认可。

Debates

迁徙叙事与伦理考量

学者们讨论遗传数据应在多大程度上推动过去“民族”和迁徙的叙事，并提出了围绕人类遗骸取样以及与后代和原住民社区互动的伦理问题。

Key figures

• Svante Pääbo
• David Reich
• Terence A. Brown

Seminal works

• paabo2014
• reich2018
• brownbrown2011

Frequently asked questions

古代DNA能有多古老？

在有利的保存条件下，已从数十万年前的遗骸中回收了经鉴定的DNA，尽管大多数考古aDNA研究处理的是过去数万年内的材料。

为什么污染如此令人担忧？

古代DNA仅以微小、受损的量存在，因此即使是来自处理人员或环境的微量现代DNA也可能将其淹没，这就是为什么严格的洁净室控制和损伤检查至关重要。