Process / pipelineBioinformatics / omics
时间序列基因集富集分析 — 时间点间的动态通路富集
时间序列基因集富集分析（TS-GSEA）将经典的GSEA框架扩展至检测在时间上具有生物学协调变化的基因集——通路、基因本体论术语或已注释的特征——的框架。它并非比较两个快照，而是对基因表达的完整时间轨迹进行建模，以识别在发育、治疗反应或疾病进展等生物过程中被激活、抑制或动态重塑的功能程序。
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来源
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545–15550. DOI: 10.1073/pnas.0506580102 ↗
- Nueda, M. J., Tarazona, S., & Conesa, A. (2014). Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time series. Bioinformatics, 30(18), 2598–2602. DOI: 10.1093/bioinformatics/btu333 ↗
如何引用本页
ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/time-series-gene-set-enrichment-analysis
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- 基因集富集分析 (GSEA)生物信息学↔ 比较
- 多组学基因集富集分析生物信息学↔ 比较
- 通路富集分析生物信息学↔ 比较
- RNA-seq差异表达生物信息学↔ 比较
- Single-cell RNA-seq analysis生物信息学↔ 比较
- 时间序列 RNA-seq 差异表达生物信息学↔ 比较
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