Xét nghiệm Dược lý Di truyền học và Triển khai Lâm sàng
Xét nghiệm dược lý di truyền học và triển khai lâm sàng là khía cạnh ứng dụng của dược lý di truyền học: cách thức biến thể di truyền trong các gen xử lý thuốc và gen đích của thuốc được đo lường trong mẫu bệnh phẩm của bệnh nhân, được chuyển đổi thành kiểu hình đáp ứng thuốc dự đoán, và được cung cấp cho các bác sĩ lâm sàng dưới dạng có thể sử dụng được. Nó bao gồm các công nghệ phòng thí nghiệm phát hiện các biến thể, các khuôn khổ bằng chứng quyết định cặp gen-thuốc nào có thể hành động được, các mô hình về thời điểm xét nghiệm, các tiêu chuẩn báo cáo kết quả và các hệ thống điện tử cung cấp hướng dẫn tại thời điểm kê đơn.
Definition
Xét nghiệm dược lý di truyền học và triển khai lâm sàng là tập hợp các quy trình phòng thí nghiệm, diễn giải và tin học, theo đó biến thể di truyền ảnh hưởng đến đáp ứng thuốc được phát hiện, phân loại thành kiểu hình, báo cáo và tích hợp vào quy trình làm việc lâm sàng để thông báo các quyết định kê đơn.
Scope
Lĩnh vực này định hướng cho người đọc về quy trình từ xét nghiệm di truyền đến hành động lâm sàng. Nó giới thiệu các công nghệ định kiểu gen và giải trình tự được sử dụng trong các phòng thí nghiệm dược lý di truyền học, các khuôn khổ hướng dẫn và mức độ bằng chứng (đáng chú ý là của Hiệp hội Triển khai Dược lý Di truyền Lâm sàng), lựa chọn chiến lược giữa xét nghiệm chủ động và phản ứng, việc giải thích và báo cáo kết quả theo tiêu chuẩn, và các hệ thống hỗ trợ quyết định lâm sàng tích hợp các cảnh báo dược lý di truyền học vào hồ sơ sức khỏe điện tử. Nó coi đây là các chủ đề tham khảo trong khoa học triển khai và y học xét nghiệm, không phải là hướng dẫn lâm sàng.
Sub-topics
Core questions
- Biến thể di truyền trong các gen dược lý được phát hiện như thế nào, và các công nghệ khác nhau thu được hoặc bỏ sót những gì?
- Cặp gen-thuốc nào có đủ bằng chứng để có thể hành động lâm sàng, và ai quyết định?
- Việc định kiểu gen nên được thực hiện chủ động trên toàn bộ dân số hay phản ứng tại thời điểm cân nhắc một loại thuốc?
- Kiểu gen thô được chuyển đổi thành kiểu hình tiêu chuẩn hóa và được truyền đạt trong báo cáo lâm sàng như thế nào?
- Làm thế nào để hướng dẫn dược lý di truyền học có thể được cung cấp đáng tin cậy cho người kê đơn mà không gây mệt mỏi do cảnh báo?
Key concepts
- Khả năng hành động của cặp gen-thuốc
- Chuyển đổi kiểu gen thành kiểu hình
- Danh pháp alen sao (*)
- Xét nghiệm chủ động so với xét nghiệm phản ứng
- Hỗ trợ quyết định lâm sàng và hồ sơ sức khỏe điện tử
- Mức độ bằng chứng và độ mạnh của hướng dẫn
- Thuật ngữ kết quả tiêu chuẩn hóa
Mechanisms
Việc triển khai tuân theo một quy trình. Một phòng thí nghiệm phát hiện các biến thể trong các gen dược lý bằng cách sử dụng các mảng định kiểu gen mục tiêu hoặc giải trình tự; các alen được phát hiện được đặt tên bằng danh pháp sao-alen và kết hợp thành một kiểu gen lưỡng bội (diplotype). Kiểu gen lưỡng bội được chuyển đổi thành kiểu hình chuyển hóa hoặc đáp ứng dự đoán bằng cách sử dụng các quy tắc đồng thuận. Các khuôn khổ bằng chứng như của Hiệp hội Triển khai Dược lý Di truyền Lâm sàng đánh giá cặp gen-thuốc nào có đủ bằng chứng để có thể hành động và công bố hướng dẫn về cách một kiểu hình nhất định liên quan đến đáp ứng thuốc. Kết quả được báo cáo bằng các thuật ngữ tiêu chuẩn và, ngày càng tăng, được lưu trữ trong hồ sơ sức khỏe điện tử để hỗ trợ quyết định lâm sàng có thể đưa ra hướng dẫn liên quan khi một loại thuốc bị ảnh hưởng được kê đơn (Roden, 2019; Relling & Klein, 2011; Relling et al., 2019).
Clinical relevance
Triển khai dược lý di truyền học mô tả cơ sở hạ tầng thông qua đó thông tin di truyền về đáp ứng thuốc có thể tiếp cận chăm sóc lâm sàng; việc hiểu nó giúp các bác sĩ lâm sàng, nhân viên phòng thí nghiệm và chuyên gia tin học đánh giá những gì một báo cáo dược lý di truyền học có thể và không thể hỗ trợ. Các chủ đề ở đây mô tả cách bằng chứng và kết quả được tạo ra, tiêu chuẩn hóa và cung cấp, và được coi là định hướng tham khảo chứ không phải là nguồn cung cấp các quyết định kê đơn hoặc liều lượng cá nhân hóa.
Evidence & guidelines
Khuôn khổ bằng chứng chủ đạo trong lĩnh vực này là Hiệp hội Triển khai Dược lý Di truyền Lâm sàng (CPIC), tổ chức này đánh giá mức độ mạnh của bằng chứng gen-thuốc và ban hành các hướng dẫn được bình duyệt mô tả cách hành động dựa trên một kiểu gen đã được xác định; Nhóm Công tác Dược lý Di truyền Hà Lan cung cấp một khuôn khổ song song của Châu Âu (Relling & Klein, 2011; Relling et al., 2019). Các chương trình tiền cứu lớn như dự án PREDICT của Vanderbilt đã chứng minh các mô hình hoạt động để tích hợp định kiểu gen và hỗ trợ quyết định vào chăm sóc thường quy (Pulley et al., 2012). Các khuôn khổ này mô tả bằng chứng và quy trình; chúng không thay thế cho phán đoán lâm sàng.
History
Triển khai dược lý di truyền học đã phát triển từ nhiều thập kỷ nghiên cứu dược lý di truyền thành một lĩnh vực lâm sàng có tổ chức vào những năm 2010. Việc thành lập Hiệp hội Triển khai Dược lý Di truyền Lâm sàng vào năm 2009 đã cung cấp một khuôn khổ chung để biến các mối liên hệ gen-thuốc thành các hướng dẫn có thể hành động (Relling & Klein, 2011), và các chương trình thể chế ban đầu như dự án PREDICT của Vanderbilt đã cho thấy cách định kiểu gen tiền cứu và hỗ trợ quyết định điện tử có thể được vận hành (Pulley et al., 2012). Một thập kỷ sau, lĩnh vực này đã trưởng thành thành một khoa học triển khai có thể nhận biết với thuật ngữ tiêu chuẩn hóa và tích hợp hồ sơ sức khỏe điện tử ngày càng tăng (Relling et al., 2019; Roden, 2019).
Debates
- Xét nghiệm chủ động so với xét nghiệm phản ứng
- Việc định kiểu gen cho bệnh nhân trước để có kết quả trước khi kê đơn bất kỳ loại thuốc nào, hay chỉ xét nghiệm phản ứng khi một loại thuốc cụ thể đang được cân nhắc, liên quan đến sự đánh đổi về chi phí, sự sẵn sàng của dữ liệu và hiệu quả lâm sàng vẫn đang được thảo luận tích cực.
Key figures
- Mary V. Relling
- Teri E. Klein
- Dan M. Roden
- Kelly E. Caudle
- Josh F. Peterson
Related topics
Seminal works
- relling-2011
- pulley-2012
- relling-2019
- roden-2019
Frequently asked questions
- Sự khác biệt giữa xét nghiệm dược lý di truyền (pharmacogenetic) và dược lý di truyền học (pharmacogenomic) là gì?
- Dược lý di truyền theo truyền thống đề cập đến mối quan hệ gen-thuốc đơn lẻ trong khi dược lý di truyền học bao gồm các ảnh hưởng trên toàn bộ bộ gen đến đáp ứng thuốc; trong triển khai lâm sàng, các thuật ngữ này hiện nay phần lớn được sử dụng thay thế cho nhau để chỉ xét nghiệm dự đoán đáp ứng thuốc từ biến thể di truyền.
- Một xét nghiệm dược lý di truyền học có cho bác sĩ lâm sàng biết chính xác nên kê đơn gì không?
- Không. Một xét nghiệm báo cáo một kiểu hình dự đoán; việc biến điều đó thành quyết định kê đơn dựa trên các hướng dẫn dựa trên bằng chứng và phán đoán lâm sàng có tính đến toàn bộ bệnh nhân, và kết quả xét nghiệm đơn thuần không phải là hướng dẫn điều trị.