Пошук за профілями HMMER
Пошук за профілями HMMER ідентифікує віддалені гомологи білкових послідовностей за допомогою ймовірнісних моделей білкових родин, відомих як приховані Марковські моделі профілів (HMM). Розроблений Едді та його колегами, цей метод охоплює патерни варіацій послідовностей у межах білкових родин і виявляє гомологи зі значно вищою чутливістю, ніж матриці ваги позицій або попарне вирівнювання.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/hmmer-profile-search
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Кріо-ЕМ реконструкціяБіоінформатика↔ порівняти
- Метагеномне бінінґуванняБіоінформатика↔ порівняти
- Молекулярний докінгБіоінформатика↔ порівняти
Згадується в
Similar methods
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →