Аналіз CRISPR-скринінгів
Аналіз CRISPR-скринінгів обробляє дані з пул-скринінгів геному за допомогою CRISPR-Cas9 для ідентифікації генів, необхідних для росту клітин, виживання або фенотипу за специфічних умов. Цей обчислювальний конвеєр, розроблений Чжаном, Санджаною та іншими, трансформує результати секвенування кількості направляючих РНК (guide RNA, gRNA) у ранжовані списки функціональних генів.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Джерела
- Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. DOI: 10.1126/science.1247005 ↗
- Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. link ↗
- King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/crispr-screen-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Де ново збірка транскриптомуБіоінформатика↔ compare
- Пошук за профілями HMMERБіоінформатика↔ compare
- Метагеномне бінінґуванняБіоінформатика↔ compare
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →