Топологія мережі білок-білкових взаємодій
Аналіз мережі білок-білкових взаємодій (PPI) ідентифікує та характеризує структурні властивості клітинних мереж взаємодій. Започаткований Уетцем та його колегами за допомогою великомасштабного скринінгу дріжджового двогібридного методу, цей підхід виявляє топологічні особливості, такі як хаби, модулі та мотиви, що кодують функціональну організацію та асоціації з хворобами.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/bioinformatics/ppi-network-topology
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Кріо-ЕМ реконструкціяБіоінформатика↔ порівняти
- Пошук за профілями HMMERБіоінформатика↔ порівняти
- Молекулярний докінгБіоінформатика↔ порівняти
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →