Test Doğrulaması ve Performans Değerlendirmesi
Test doğrulaması ve performans değerlendirmesi, bir moleküler testin iddia ettiği şeyi tekrarlanabilir bir şekilde ölçtüğünü ve amaçlanan klinik kullanımını desteklediğini gösteren bir çalışma bütünüdür. Bu süreç, analitik doğrulamayı (analiz, analiti doğru ölçüyor mu?) klinik doğrulamadan (sonuç klinik durumu yansıtıyor mu?) ayırmakta ve doğruluk, kesinlik, duyarlılık, özgüllük ve saptama limitleri gibi metriklerle performansı nicel olarak belirlemektedir.
Tanım
Test doğrulaması, sistematik deneyler aracılığıyla bir laboratuvar testinin doğru ve tekrarlanabilir bir şekilde çalıştığını ve amaçlanan klinik amacına uygun olduğunu gösteren belgelenmiş bir süreçtir; performans değerlendirmesi ise bu özelliklerin sürekli ölçümü ve doğrulanmasıdır.
Kapsam
Bu madde, moleküler test performansının klinik kullanımdan önce belirlenmesi ve belgelenmesi ile sonrasında doğrulanması için kullanılan kavramları ve metrikleri kapsamaktadır: analitik ve klinik geçerlilik, standart performans özellikleri ve yüksek karmaşıklıkta analizler ile bunların biyoinformatik boru hatları için özel hususlar. Bu, metodolojik bir konudur ve hastaların teşhisi veya tedavisi için herhangi bir talimat içermemektedir.
Temel sorular
- Analitik ve klinik geçerlilik arasındaki fark nedir?
- Bir moleküler test için hangi performans özellikleri belirlenmelidir?
- Saptama ve niceleme limitleri nasıl belirlenir?
- Sadece laboratuvar analizi değil, dizileme ve biyoinformatik boru hattı nasıl doğrulanır?
Anahtar kavramlar
- Analitik geçerlilik
- Klinik geçerlilik
- Doğruluk ve gerçeklik
- Kesinlik (tekrarlanabilirlik ve yeniden üretilebilirlik)
- Analitik duyarlılık ve saptama limiti
- Analitik özgüllük
- Raporlanabilir ve ölçülebilir aralık
- Biyoinformatik boru hattı doğrulaması
- Amaçlanan kullanıma uygunluk
Mekanizmalar
Doğrulama, karakterize edilmiş örnekler kullanılarak tasarlanmış deneylerle ilerlemektedir. Doğruluk, bir referans yöntem veya bilinen numunelerle karşılaştırılarak değerlendirilmektedir; kesinlik, tekrarlanabilirlik ve yeniden üretilebilirlik koşulları altında tekrarlanan ölçümlerle; analitik duyarlılık, saptama limitinin belirlenmesiyle; ve analitik özgüllük ise girişimler ve çapraz reaktivite açısından test edilerek sağlanmaktadır (Jennings ve diğerleri, 2009). Kantitatif moleküler analizler, diğer ölçülenler için kullanılan aynı klinik kimya çerçevesiyle doğrulanabilmektedir; bu durum, damlacık dijital PCR sıvı biyopsi analizleri için gösterilmiştir (Milosevic ve diğerleri, 2018). Yeni nesil dizileme için, varyantları çağıran ve filtreleyen hesaplama boru hattı, laboratuvar adımlarıyla birlikte doğrulanmalıdır (Roy ve diğerleri, 2018). Bunlardan farklı olarak klinik geçerlilik, sonucun klinik durumu ne kadar iyi sınıflandırdığını sorgulamaktadır.
Klinik önem
Bir moleküler sonucun hasta bakımında güvenilir olup olmadığı, arkasındaki doğrulama ve performans çalışmalarına dayanmaktadır; belgelenmemiş veya zayıf performans özellikleri yorumlamayı zayıflatmaktadır. Bu madde, laboratuvarların bu güveni nasıl oluşturduğunu açıklamakta olup, belirli testlerin sipariş edilmesi veya bunlara göre hareket edilmesi için bir rehber değildir.
Kanıt ve kılavuzlar
Doğrulama uygulamaları, moleküler patoloji testlerini ve dizileme boru hatlarını doğrulamaya yönelik AMP/CAP prensipleri (Jennings ve diğerleri, 2009; Roy ve diğerleri, 2018) ve CLSI konsensüs belgeleri (CLSI EP28) dahil olmak üzere profesyonel kılavuzlarda kodlanmıştır. Bunlar, laboratuvarların akreditasyon kapsamında takip ettiği deneysel tasarımları ve kabul kriterlerini sağlamaktadır.
Tarihçe
Klinik moleküler testlerin yaygınlaşmasıyla birlikte, profesyonel kuruluşlar yerleşik klinik kimya ve laboratuvar tıbbı doğrulama prensiplerini moleküler analizlere uyarlamış, ardından bunları yüksek paralel dizilemeye ve biyoinformatiğine genişleterek günümüzde kullanılan katmanlı doğrulama standartlarını oluşturmuştur (Jennings ve diğerleri, 2009; Roy ve diğerleri, 2018).
Tartışmalar
- Doğrulama, yüksek karmaşıklıktaki, çok hedefli analizlere nasıl ölçeklenmelidir?
- Geniş dizileme panelleriyle saptanabilen her olası varyant için performans belirlemek pratik değildir, bu nedenle kılavuzlar temsili doğrulama ve boru hattı doğrulamasına dayanmaktadır; ne kadarının yeterli olduğu aktif bir tartışma konusu olmaya devam etmektedir.
İlgili konular
Temel eserler
- jennings-2009
- roy-2018
Sıkça sorulan sorular
- Analitik geçerlilik ile klinik geçerlilik arasındaki fark nedir?
- Analitik geçerlilik, analizin analiti doğru ve tekrarlanabilir bir şekilde ölçüp ölçmediğidir; klinik geçerlilik ise sonucun, testin saptamayı amaçladığı klinik duruma gerçekten karşılık gelip gelmediğidir.
- Yeni nesil dizileme neden boru hattı doğrulamasına ihtiyaç duyar?
- Çünkü raporlanan varyantlar, okumaları hizalayan ve varyantları çağıran yazılıma bağlıdır, biyoinformatik boru hattı hatalara yol açabilir ve laboratuvar prosedürüyle birlikte doğrulanmalıdır.