Numune Toplama ve İşleme
Numune toplama ve işleme, her mikrobiyoloji sonucunun kalitesini belirleyen pre-analitik adımlardır: enfeksiyon bölgesini temsil eden bir örneğin seçilmesi ve elde edilmesi, organizmaları koruyan koşullar altında taşınması ve kültür veya test için hazırlanması bu adımları içermektedir. Buradaki hatalar iş akışının ilerleyen aşamalarında düzeltilemediği için tanısal doğruluk açısından belirleyici bir rol oynamaktadır.
Tanım
Numune toplama ve işleme, klinik olarak temsili bir örneğin elde edilmesi, organizma canlılığını sürdürmek ve kontaminasyonu önlemek amacıyla taşınması ve saklanması ile laboratuvarda kültür veya diğer testler için hazırlanması gibi pre-analitik faaliyetleri ifade etmektedir.
Kapsam
Bu konu, şüpheli enfeksiyon için doğru numunenin seçilmesi, kontaminasyonu önlemek amacıyla aseptik toplama, taşıma ve saklama koşulları ile ekim, konsantrasyon ve triyaj gibi laboratuvar işleme prensiplerini kapsamaktadır. Metodolojik bir konu olarak ele alınmakta olup, bireysel hastalar için toplama talimatları sunmamaktadır.
Temel sorular
- Şüpheli bir enfeksiyon için doğru numune nasıl seçilir?
- Toplama tekniği kontaminasyonu ve verimi nasıl etkiler?
- Hangi taşıma ve saklama koşulları organizma canlılığını korur?
- Laboratuvar, alınan numuneleri nasıl triyaj eder ve işler?
Anahtar kavramlar
- Pre-analitik faz
- Temsili numune
- Aseptik toplama
- Kontaminasyon ve normal flora
- Taşıma besiyeri ve işleme süresi
- Numune ret kriterleri
- Kan kültürü toplama
Mekanizmalar
Bir numune, ancak enfeksiyon bölgesinden örnek alırken kolonize floradan kaynaklanan kontaminasyonu en aza indiriyorsa faydalı kabul edilmektedir; kan kültürleri için cilt antisepsisi ve yeterli hacim, kontaminasyonu azaltarak tespiti iyileştirmektedir (Hall 2006). Taşıma koşulları ve işleme süresi büyük önem taşımaktadır, zira bazı organizmalar gecikme durumunda canlılıklarını kaybedebilmekte veya aşırı çoğalabilmektedir. Laboratuvar, numuneleri teslim aldığında, kalitesiz numuneler için ret kriterlerini uygulamakta, ardından bunları doğrudan inceleme, konsantrasyon veya uygun besiyerlerine ekim yoluyla işlemektedir. Derin veya cihazla ilişkili enfeksiyonlar için sonikasyon veya doku örneklemesi gibi özel işlemler, geri kazanımı artırabilmektedir (Tande 2014). Rehberler, numune toplamayı, tüm sonraki sonuçların geçerliliğini şekillendiren ortak bir klinisyen-laboratuvar sorumluluğu olarak tanımlamaktadır (Baron 2013).
Klinik önem
Pre-analitik kalite, birçok şaşırtıcı sonucu açıklayabilmektedir: kontamine bir kan kültürü bakteriyemiyi taklit edebilirken, kötü toplanmış veya gecikmiş bir numune yanlış negatif kültür sonucuna yol açabilmektedir. Bu adımları anlamak, mikrobiyoloji raporlarının eleştirel değerlendirmesini desteklemektedir; konu, sonuçların nasıl üretildiğini tanımlamakta olup, bireysel tanı veya tedavi kararları için bir temel oluşturmamaktadır.
Kanıt ve kılavuzlar
Kullanım kılavuzları, enfeksiyon hastalıklarının tanısı için uygun numuneleri, toplama ve taşıma yöntemlerini belirtmektedir (Baron 2013); derlemeler kan kültürü kontaminasyonunu nicelendirmekte ve ele almakta (Hall 2006), ayrıca cihazla ilişkili enfeksiyonlar için özelleşmiş örneklemeyi tanımlamaktadır (Tande 2014). Referans metinler, laboratuvar işleme yöntemlerini detaylandırmaktadır (Jorgensen 2015).
Tarihçe
Tanısal doğruluğun analizden önce başladığının fark edilmesi, standartlaştırılmış toplama ve taşıma uygulamalarına ve resmi numune ret kriterlerine yol açmıştır. Bu gelişmeler, klinik mikrobiyoloji yöntemlerinin daha geniş kodifikasyonuna eşlik eden iyileştirmeler olarak kabul edilmektedir (Jorgensen 2015; Baron 2013).
İlgili konular
Temel eserler
- baron-2013
- hall-2006
- tande-2014
Sıkça sorulan sorular
- Mikrobiyolojide pre-analitik faz neden bu kadar önemlidir?
- Çünkü bir sonuç, geldiği numuneden daha iyi olamaz; temsili olmayan, kontamine veya uygunsuz taşınmış bir örnek, sonraki adımların düzeltemeyeceği yanıltıcı kültür sonuçları üretebilmektedir.
- Kan kültürü kontaminasyonu nedir?
- Toplama sırasında kan dolaşımından ziyade cilt veya çevresel organizmaların bulaşmasıyla ortaya çıkan bir durumdur ve gerçek bakteriyemiyi taklit edebilmektedir; dikkatli antisepsi ve yeterli hacim, bu durumun sıklığını azaltmaktadır.