Bakteriyel Kültür Ortamları ve Üreme Koşulları
Bakteriyel kültür ortamları, klinik bakterilerin üremesi için kullanılan besin preparatlarıdır; üreme koşulları ise bu bakterilerin inkübe edildiği fiziksel ve atmosferik ayarlardır. Bu ikisi birlikte, bir laboratuvarın bir örnekten hangi organizmaları izole edebileceğini belirlemektedir ve bunların doğru seçimi, kültür tabanlı tanının temelini oluşturmaktadır.
Tanım
Bakteriyel kültür ortamları, bakteriyel üreme için gerekli besinleri sağlayan katı veya sıvı substratlardır; üreme koşulları ise, ilgilenilen organizmaları izole etmek amacıyla aşılanmış ortamların inkübe edildiği kontrollü fiziksel ve atmosferik parametrelerdir.
Kapsam
Bu konu, klinik bakteriyolojide kullanılan genel amaçlı, zenginleştirilmiş, seçici ve ayırıcı formülasyonlar dahil olmak üzere kültür ortamlarının bileşimini ve sınıflarını ele almaktadır. Ayrıca, sıcaklık, atmosfer ve süre gibi izolasyonu yöneten inkübasyon değişkenlerini de kapsamaktadır. Konu, kültür ortamlarını ve üreme koşullarını metodolojik bir mesele olarak ele almakta olup, bireysel hastalar için klinik talimatlar sunmamaktadır.
Temel sorular
- Genel amaçlı, zenginleştirilmiş, seçici ve ayırıcı ortamları birbirinden ayıran nedir?
- İnkübasyon sıcaklığı, atmosferi ve süresi izolasyonu nasıl etkilemektedir?
- Bazı bakteriler neden üremek için özel ortamlara veya atmosferlere ihtiyaç duymaktadır?
Anahtar kavramlar
- Zenginleştirilmiş ortamlar
- Seçici ortamlar
- Ayırıcı ortamlar
- Aerobik, anaerobik ve kapnofilik inkübasyon
- Besin açısından seçici (fastidious) organizmalar
- Katı ve sıvı (besiyeri) kültür
- Kromojenik ortamlar
Mekanizmalar
Kültür ortamları karbon, azot, tuzlar ve büyüme faktörleri sağlamaktadır; ayrıca, besin açısından seçici (fastidious) organizmaları desteklemek için kan veya diğer zenginleştiricilerle takviye edilebilmektedir. Seçici ortamlar, istenmeyen florayı baskılarken hedef organizmaların üremesine izin veren ajanlar içermektedir. Ayırıcı ortamlar ise, metabolik bir özelliği ortaya koyan göstergeler içermekte ve kolonilerin ayırt edilmesine yardımcı olmaktadır. Üreme aynı zamanda inkübasyona da bağlıdır: birçok patojen vücut sıcaklığına yakın koşullarda en iyi şekilde üremektedir, bazıları karbondioksitçe zenginleştirilmiş (kapnofilik) bir atmosfere ihtiyaç duymaktadır ve zorunlu anaeroblar oksijenin dışlanmasını gerektirmektedir. Ortamın ve atmosferin şüpheli patojene ve örnek tipine uygun hale getirilmesi, izolasyonu en üst düzeye çıkarmaktadır; bu nedenle laboratuvarlar, kültür düzeneklerini klinik soruya göre uyarlamaktadır (Baron 2013; Jorgensen 2015).
Klinik önem
Kültür ortamlarının ve koşullarının seçimi, spesifik yöntemler talep edilmedikçe rutin bir kültürün besin açısından seçici (fastidious) veya anaerobik organizmaları neden gözden kaçırabileceğini ve bir organizmanın izolasyonunun laboratuvarın bunu öngörmesine neden bağlı olduğunu açıklamaktadır. Bu anlayış, kültür raporlarının eleştirel bir şekilde okunmasını desteklemektedir; sonuçların nasıl üretildiğini tanımlamakta olup, bireysel tanı veya tedavi kararları için bir temel oluşturmamaktadır.
Kanıt ve kılavuzlar
Standart referans metinleri, klinik bakteriyolojide kültür ortamlarının ve inkübasyon koşullarının formülasyonunu ve kullanımını tanımlamaktadır (Jorgensen 2015); kullanım kılavuzları ise örnek tipini uygun kültür düzenekleriyle ilişkilendirmektedir (Baron 2013).
Tarihçe
Katı kültür ortamları, on dokuzuncu yüzyılın sonlarında saf kolonilerin izole edilmesine olanak tanıyarak bakteriyolojiyi dönüştürmüştür. Ardından geliştirilen zenginleştirilmiş, seçici ve ayırıcı formülasyonlar, izole edilebilen ve ayırt edilebilen organizma yelpazesini genişletmiş, bu yöntemler standart el kitaplarında kodifiye edilmiştir (Jorgensen 2015).
İlgili konular
Temel eserler
- jorgensen-2015
- baron-2013
Sıkça sorulan sorular
- Seçici ve ayırıcı ortamlar arasındaki fark nedir?
- Seçici ortamlar, istenmeyen organizmaları inhibe eden ajanlar içermektedir, böylece hedef bakterilerin üremesine olanak tanınmaktadır; ayırıcı ortamlar ise, belirli bir metabolik özelliğe sahip kolonileri görsel olarak ayırt edilebilir kılan göstergeler barındırmaktadır; tek bir ortam hem seçici hem de ayırıcı olabilmektedir.
- Enfeksiyon mevcutken bile bir kültür neden negatif çıkabilir?
- Besin açısından seçici (fastidious), anaerobik veya yavaş üreyen organizmalar, rutin ortamlarda veya standart atmosfer koşullarında üreyemeyebilmektedir; bu nedenle izolasyon, laboratuvarın şüpheli patojene uygun ortam ve inkübasyon koşullarını kullanmasına bağlıdır.