Metagenomic Binning
Metagenomic binning คือ กระบวนการแบ่งกลุ่มลำดับจีโนมที่ประกอบขึ้นจากชิ้นส่วนดีเอ็นเอ (assembled contigs) จากชุมชนจุลินทรีย์ที่ซับซ้อน ออกเป็นกลุ่มจีโนมที่แตกต่างกัน โดยแต่ละกลุ่มจะแสดงถึงสิ่งมีชีวิตหรือสายพันธุ์เดียว กระบวนการนี้ซึ่งริเริ่มโดย Banfield และคณะ สามารถแยกจีโนมของสิ่งมีชีวิตเดี่ยว (metagenome-assembled genomes หรือ MAGs) ออกจากตัวอย่างสิ่งแวดล้อมได้โดยไม่จำเป็นต้องเพาะเลี้ยงเชื้อให้ได้ผลผลิตเป็นเซลล์เดี่ยว
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
แผนที่ระเบียบวิธี
ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ
แหล่งอ้างอิง
- Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. DOI: 10.7717/peerj.1165 ↗
- Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. DOI: 10.1038/s41467-018-07641-9 ↗
- Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. DOI: 10.1038/s41564-018-0171-1 ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Metagenome Assembly and Genome Binning. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/metagenomic-binning
ระเบียบวิธีใด?
วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน
- การวิเคราะห์การคัดกรอง CRISPRชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การประกอบทรานสคริปโตมแบบเดโนโวชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การค้นหาโปรไฟล์ HMMERชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ