การค้นหาโปรไฟล์ HMMER
การค้นหาโปรไฟล์ HMMER ระบุลำดับโปรตีนที่เป็นญาติห่างๆ โดยใช้แบบจำลองเชิงความน่าจะเป็นของตระกูลโปรตีน ซึ่งเรียกว่าโปรไฟล์ Hidden Markov Models (HMMs) วิธีการนี้พัฒนาโดย Eddy และคณะ สามารถจับรูปแบบความแปรปรวนของลำดับภายในตระกูลโปรตีน และตรวจจับญาติห่างๆ ได้อย่างมีความไวสูงกว่าเมทริกซ์น้ำหนักตำแหน่ง (position-weight matrices) หรือการจัดแนวลำดับแบบคู่ (pairwise alignment) อย่างมาก
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
แผนที่ระเบียบวิธี
ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ
แหล่งอ้างอิง
- Krogh, A., Brown, M., Mian, I. S., Sjölander, K., & Haussler, D. (1994). Hidden Markov models in computational biology: applications to protein modeling. Journal of Molecular Biology, 235(5), 1501-1531. DOI: 10.1006/jmbi.1994.1104 ↗
- Eddy, S. R. (1998). Profile hidden Markov models. Bioinformatics, 14(9), 755-763. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ↗
- Finn, R. D., Clements, J., & Eddy, S. R. (2011). HMMER web server: interactive sequence similarity searching. Nucleic Acids Research, 39(Web Server issue), W29-W37. DOI: 10.1093/nar/gkr367 ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). Hidden Markov Model Profile Search for Sequence Homology. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/hmmer-profile-search
ระเบียบวิธีใด?
วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน
- การสร้างภาพสามมิติด้วยกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบเย็นจัดชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- Metagenomic Binningชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- Molecular Dockingชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ