การวิเคราะห์การคัดกรอง CRISPR
การวิเคราะห์การคัดกรอง CRISPR ประมวลผลข้อมูลจากการคัดกรองทางพันธุกรรมแบบรวม (pooled genetic screens) โดยใช้ CRISPR-Cas9 เพื่อระบุยีนที่จำเป็นต่อการเจริญเติบโต การอยู่รอด หรือลักษณะเฉพาะของเซลล์ภายใต้เงื่อนไขที่กำหนด การวิเคราะห์นี้ซึ่งพัฒนาโดย Zhang, Sanjana และคณะ เป็นกระบวนการคำนวณที่แปลงผลการอ่านลำดับ (sequencing readouts) ของปริมาณ RNA นำ (guide RNA abundances) ไปสู่รายการยีนที่มีหน้าที่ตามลำดับความสำคัญ
อ่านวิธีฉบับเต็ม
เข้าสู่ระบบด้วยบัญชีฟรีเพื่ออ่านส่วนนี้
แผนที่ระเบียบวิธี
ย่านของระเบียบวิธีที่เกี่ยวข้องกัน — เลือกโหนดเพื่อสำรวจ
แหล่งอ้างอิง
- Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. DOI: 10.1126/science.1247005 ↗
- Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. link ↗
- King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. link ↗
วิธีอ้างอิงหน้านี้
ScholarGate. (2026, June 3). CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification. ScholarGate. https://scholargate.app/th/bioinformatics/crispr-screen-analysis
ระเบียบวิธีใด?
วางระเบียบวิธีนี้เคียงข้างระเบียบวิธีใกล้เคียงที่สุด แล้วอ่านเปรียบเทียบกัน — คลังวางหนังสือไว้บนโต๊ะให้แล้ว ส่วนการเลือกเป็นของท่าน
- การประกอบทรานสคริปโตมแบบเดโนโวชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- การค้นหาโปรไฟล์ HMMERชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ
- Metagenomic Binningชีวสารสนเทศศาสตร์↔ เปรียบเทียบ