Single-cell Gene Set Enrichment Analysis — scGSEA
Single-cell gene set enrichment analysis (scGSEA) utökar klassisk bulk GSEA till upplösningen av enskilda celler. Istället för att testa om en genuppsättning är anrikad i en jämförelse på sampel-nivå, tilldelar scGSEA en anriknings- eller aktivitets-poäng till varje cell, vilket gör det möjligt för forskare att kartlägga signalvägsaktivitet över heterogena cellpopulationer, celltillstånd och utvecklingsbanor som fångas i single-cell RNA-seq-data.
Läs hela metoden
Logga in med ett kostnadsfritt konto för att läsa avsnittet.
Metodkarta
Närområdet av besläktade metoder — välj en nod för att utforska.
Källor
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Så citerar du den här sidan
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sv/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
Vilken metod?
Placera den här metoden bredvid sina närmaste släktingar och läs dem sida vid sida — biblioteket lägger fram böckerna på bordet; valet är ditt.
- Genuppsättningsanrikningsanalys (GSEA)Bioinformatik↔ jämför
- VägberikningsanalysBioinformatik↔ jämför
- RNA-seq Differential ExpressionBioinformatik↔ jämför
- Analys av enkelcells-RNA-sekvenseringBioinformatik↔ jämför
- Analys av differentiell genexpression i enkelcells-RNA-sekvenseringBioinformatik↔ jämför
Refereras av
Similar methods
Hittade du ett fel på sidan? Rapportera eller föreslå en rättelse →