ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Nätverksbaserad genuppsättningsanrikning

Nätverksbaserad genuppsättningsanrikning (network GSEA) utvidgar klassisk GSEA genom att införliva biologiska interaktionsnätverk – såsom protein-proteininteraktionsnätverk (PPI) eller samexpressionsgrafer – i anrikningstestet. Istället för att behandla varje gen oberoende, sprider metoden signaler om differentiell expression över nätverkskanter, vilket gör att gener som är samreglerade eller funktionellt kopplade gemensamt kan stödja signifikansen hos en genuppsättning. Resultatet är en biologiskt sammanhängande anrikningspoäng som tar hänsyn till vägtopologi och gen-gen-beroenden.

Öppna i MethodMindSnartApply, compare, get guidance
Tools & resources
Ladda ner bildspel
Learn & explore
VideoSnart

Läs hela metoden

Endast för medlemmar

Logga in med ett kostnadsfritt konto för att läsa avsnittet.

Logga in

Metodkarta

Närområdet av besläktade metoder — välj en nod för att utforska.

Nätverksbaserad genuppsättningsanrikning
Genuppsättningsanrikning…Nätverksbaserad GWASVägberikningsanalysRNA-seq Differential Exp…Single-cell Gene Set Enr…Maskininlärningsassister…

Källor

  1. Shojaie, A., & Michailidis, G. (2010). Network enrichment analysis in complex experiments. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 9(1), Article 22. link ↗
  2. Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. link ↗

Så citerar du den här sidan

ScholarGate. (2026, June 3). Network-Based Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sv/bioinformatics/network-based-gene-set-enrichment-analysis

Vilken metod?

Placera den här metoden bredvid sina närmaste släktingar och läs dem sida vid sida — biblioteket lägger fram böckerna på bordet; valet är ditt.

Jämför sida vid sida →

Refereras av

Genuppsättningsanrikningsanalys (GSEA)Maskininlärningsassisterad genuppsättningsanrikningsanalys

Similar methods

Network-based pathway enrichment analysisNetwork-based RNA-seq differential expressionBayesian Gene Set Enrichment AnalysisGene Set Enrichment AnalysisPathway Enrichment AnalysisMulti-omics gene set enrichment analysisBayesian Pathway Enrichment AnalysisMachine learning-assisted gene set enrichment analysis

Related reference concepts

Pathway Enrichment and Network AnalysisFunctional Genomics and Pathway AnalysisSystems Genomics and Network BiologyGene Ontology and Biological DatabasesFunctional Annotation of Genomic VariantsGene Expression Signatures and Prognostic Markers

Hittade du ett fel på sidan? Rapportera eller föreslå en rättelse →

ScholarGate — Network-based gene set enrichment analysis (Network-Based Gene Set Enrichment Analysis). Hämtad 2026-06-15 från https://scholargate.app/sv/bioinformatics/network-based-gene-set-enrichment-analysis · Datamängd: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026