Differential Single-Cell RNA-seq Analysis

Differential single-cell RNA-seq (scRNA-seq) analysis är en beräkningspipeline som jämför transkriptomiska profiler mellan biologiska tillstånd – såsom behandlad kontra obehandlad, sjukdom kontra frisk, eller tidpunkter – med upplösning på enskilda celler. Den identifierar vilka gener, celltyper och celltillstånd som förändras mellan tillstånd, vilket ger mekanistisk insikt som jämförelser av bulk-RNA-seq inte kan erbjuda. Metoden kombinerar klustring, celltypsannotering och statistisk testning, typiskt med pseudobulkaggregering för att ta hänsyn till korrelation inom prover.