Coleta de Amostras e Confirmação Laboratorial

A confirmação laboratorial é o pilar de uma investigação de surto, estabelecendo qual é o agente e quais casos realmente o possuem. O processo começa com a coleta das amostras clínicas ou ambientais corretas, no momento certo, das pessoas certas, e continua através do transporte, teste e tipagem no laboratório, distinguindo, em última análise, os casos confirmados daqueles que meramente se enquadram numa descrição clínica.

Definition

A coleta de amostras e a confirmação laboratorial consistem na obtenção, transporte e teste de amostras clínicas ou ambientais para identificar e caracterizar o agente causador de um surto, permitindo a confirmação do diagnóstico, a classificação dos casos e a ligação laboratorial entre os casos.

Scope

Este tópico aborda o porquê e como as amostras são obtidas durante uma investigação, o papel do laboratório na verificação do diagnóstico e no refinamento da definição de caso em níveis confirmado, provável e suspeito, e o uso da tipagem laboratorial e sequenciamento genômico para ligar casos. É conceitual e metodológico. Não fornece protocolos de manuseio de amostras, limites de teste ou procedimentos de biossegurança para qualquer patógeno específico, que são regidos por diretrizes laboratoriais e de saúde pública.

Core questions

• Quais amostras, de quem e em que ponto da doença identificarão melhor o agente?
• Como as amostras são coletadas, transportadas e testadas para que os resultados sejam válidos?
• Como a confirmação laboratorial define as categorias de casos confirmados, prováveis e suspeitos?
• Como a tipagem laboratorial ou o sequenciamento do genoma podem ligar os casos uns aos outros e a uma fonte?

Key concepts

• Amostras clínicas e ambientais
• Momento da coleta em relação à doença
• Transporte de amostras e cadeia de custódia
• Categorias de casos confirmados, prováveis e suspeitos
• Sensibilidade e especificidade do teste diagnóstico
• Tipagem e subtipagem laboratorial
• Sequenciamento do genoma completo para ligação de casos

Mechanisms

Amostras apropriadas, como amostras respiratórias, fezes, sangue ou alimentos e água implicados, são coletadas de um número suficiente de casos, idealmente antes que o tratamento altere o resultado, e transportadas em condições que preservem o agente com manuseio documentado. O laboratório então detecta e identifica o agente, e esses resultados aprimoram a definição de caso em níveis: um caso confirmado atende a um critério laboratorial, enquanto casos prováveis e suspeitos baseiam-se em características clínicas ou epidemiológicas. A subtipagem e o sequenciamento do genoma completo estabelecem ainda se os casos compartilham a mesma cepa, o que apoia ou refuta sua ligação epidemiológica e ajuda a conectar os casos a uma fonte comum. O valor interpretativo de qualquer resultado depende da sensibilidade e especificidade do teste.

Clinical relevance

Clínicos e pessoal de laboratório coletam as amostras e geram os resultados que confirmam o agente de um surto e classificam seus casos, portanto, a qualidade e o momento da coleta afetam diretamente a investigação. A compreensão da confirmação laboratorial ajuda os profissionais de saúde a interpretar por que um caso é classificado como confirmado em vez de suspeito. Esta entrada descreve o papel da confirmação laboratorial nas investigações e não é um protocolo de manuseio de amostras, biossegurança ou diagnóstico para qualquer patógeno específico.

Epidemiology

A confirmação laboratorial foi central para o reconhecimento da SARS como uma nova doença distinta em 2003, onde a caracterização clínica e laboratorial definiu a síndrome e seus casos. De forma mais ampla, a integração do sequenciamento do genoma de patógenos com dados epidemiológicos tornou-se uma forma padrão de confirmar agentes e ligar casos em investigações de surtos, fortalecendo tanto a classificação de casos quanto a atribuição da fonte.

History

A bacteriologia no final do século XIX permitiu pela primeira vez que surtos fossem ligados a organismos específicos identificados, e a epidemiologia de campo do século XX incorporou a confirmação laboratorial nas definições de caso em níveis de casos confirmados, prováveis e suspeitos. A subtipagem molecular e, mais recentemente, o sequenciamento do genoma completo estenderam o papel do laboratório de nomear o agente para resolver quais casos estão ligados, integrando evidências laboratoriais e epidemiológicas.

Debates

Como as definições de caso devem equilibrar a confirmação laboratorial com a sensibilidade?

Exigir confirmação laboratorial aumenta a especificidade, mas pode perder casos reais que não apresentam um teste positivo, enquanto definições clínicas amplas capturam mais casos ao custo de incluir não-casos; as investigações, portanto, usam definições em níveis e as ajustam à medida que a capacidade de teste e as necessidades da investigação evoluem.

Key figures

• Michael Gregg
• Yonatan Grad
• Marc Lipsitch

Seminal works

• lee-2003
• grad-lipsitch-2014

Frequently asked questions

Por que os casos são classificados como confirmados, prováveis ou suspeitos?

As definições de caso em níveis permitem que uma investigação equilibre precisão e completude: os casos confirmados atendem a um critério laboratorial e são os mais específicos, enquanto as categorias prováveis e suspeitas abrangem casos clinicamente ou epidemiologicamente compatíveis que carecem de confirmação laboratorial, para que casos reais não sejam perdidos precocemente.

Como o sequenciamento do genoma ajuda a confirmar um surto?

Além de nomear o agente, o sequenciamento compara os genomas de isolados de diferentes casos; sequências intimamente relacionadas apoiam a conclusão de que os casos fazem parte do mesmo surto e podem compartilhar uma fonte, complementando a evidência epidemiológica.