Análise de RNA-seq de Célula Única em Séries Temporais — Transcriptômica Temporal em Resolução de Célula Única
A análise de RNA-seq de célula única em séries temporais captura a expressão gênica em múltiplos pontos de tempo em resolução de célula única para revelar como as populações celulares emergem, transitam e divergem durante processos biológicos dinâmicos, como desenvolvimento, diferenciação ou progressão de doenças. Ao combinar ordenação por pseudotempo, velocidade de RNA e teste de dinâmica diferencial, os pesquisadores reconstroem a trajetória temporal de células individuais e identificam as mudanças regulatórias gênicas que impulsionam as transições biológicas.
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Fontes
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., Lidschreiber, K., Kastriti, M. E., Lonnerberg, P., Furlan, A., Fan, J., Borm, L. E., Liu, Z., van Bruggen, D., Guo, J., He, X., Linnarsson, S., & Kharchenko, P. V. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7719), 494-498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
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ScholarGate. (2026, June 3). Time-Series Single-Cell RNA Sequencing Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pt/bioinformatics/time-series-single-cell-rna-seq-analysis
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