효소 분류 및 EC 번호 부여

효소 분류는 알려진 수천 가지 효소를 구조나 기원이 아닌 촉매하는 화학 반응에 따라 체계화합니다. 효소 위원회(EC) 번호 부여 시스템은 각 촉매 활동에 네 부분으로 구성된 번호를 할당하여 생물학자와 임상의에게 특성화된 모든 효소에 대해 고유하고 언어 독립적인 표지를 제공합니다.

Definition

EC 번호 부여는 IUBMB에 의해 유지되는 계층적 분류이며, 각 효소 활동에는 반응 클래스, 서브클래스, 서브-서브클래스 및 일련 식별자를 인코딩하는 4부분으로 구성된 번호(예: EC 1.1.1.1)가 할당됩니다.

Scope

이 항목은 반응 기반 분류의 원리, 7가지 최상위 EC 클래스 및 4부분으로 구성된 EC 번호의 의미, EC 번호(활동)와 유전자 또는 단백질 간의 구별, 그리고 시스템을 유지 관리하는 큐레이션된 자료를 다룹니다. 이는 효소 명명법에 대한 참고 자료이며, 임상 지침은 아닙니다.

Core questions

• 효소는 어떤 기준으로 분류됩니까?
• 7가지 EC 최상위 클래스는 무엇을 나타냅니까?
• EC 코드의 네 가지 숫자 각각은 무엇을 의미합니까?
• EC 번호가 특정 단백질이 아닌 활동을 설명하는 이유는 무엇입니까?

Key concepts

• 반응 기반 분류
• 4부분 EC 번호
• 7가지 EC 클래스 (산화환원효소, 전이효소, 가수분해효소, 분해효소, 이성질화효소, 연결효소, 전위효소)
• 체계적 명칭 대 권장(일반) 명칭
• 활동 대 유전자/단백질 정체성
• 큐레이션된 명명법 자료 (ENZYME, BRENDA)

Mechanisms

각 효소는 촉매하는 반응의 종류에 따라 7가지 최상위 클래스 중 하나에 할당됩니다: 산화환원효소(클래스 1), 전이효소(2), 가수분해효소(3), 분해효소(4), 이성질화효소(5), 연결효소(6), 그리고 전위효소(7, 2018년 추가). 4부분으로 구성된 EC 번호는 계층적으로 설명을 좁히는데, 첫 번째 숫자는 클래스를 나타내고, 다음 두 숫자는 서브클래스 및 서브-서브클래스(일반적으로 작용하는 결합 또는 그룹)를 나타내며, 네 번째 숫자는 특정 활동에 대한 일련 번호입니다. 이 코드는 반응을 설명하기 때문에 단일 EC 번호가 여러 개의 다른 단백질 또는 유전자에 해당할 수 있으며, 하나의 단백질이 둘 이상의 EC 번호를 가질 수도 있습니다. 이 시스템은 IUBMB에 의해 큐레이션되고 업데이트되며 ENZYME 데이터베이스 및 BRENDA와 같은 자료를 통해 배포됩니다.

Clinical relevance

EC 번호는 데이터베이스, 약물-표적 설명 및 대사 경로 지도에서 효소를 참조하는 데 사용되는 표준 식별자를 제공하므로, 이 시스템은 생물의학에서 효소 정보가 공유되는 방식의 기반이 됩니다. 이 항목은 명명 체계를 설명하며 진단 또는 치료 결정의 근거가 아닙니다.

Evidence & guidelines

이 분류는 IUBMB 명명 위원회의 권고에 의해 정의되며, ENZYME 및 BRENDA를 포함한 큐레이션된 데이터베이스에서 유지 관리되며, 이는 EC 할당에 대한 권위 있는 참고 자료 역할을 합니다.

History

20세기 중반에 국제 효소 위원회가 소집되어 일관성 없는 효소 이름의 확산을 정리했으며, IUBMB가 이후 유지해 온 반응 기반의 4부분 번호 부여 체계를 도입했습니다. 이 시스템은 ENZYME 데이터베이스(Bairoch, 2000)에서 디지털화되었고, BRENDA(Jeske and colleagues, 2019; Chang and colleagues, 2021)와 같은 기능적 자료에 의해 보완되었습니다. 2018년에는 막을 가로지르는 이동을 촉매하는 효소를 수용하기 위해 7번째 클래스인 전위효소가 추가되었습니다.

Key figures

• Amos Bairoch
• Dietmar Schomburg

Seminal works

• bairoch-2000
• iubmb-recommendations-2013

Frequently asked questions

EC 코드의 네 가지 숫자는 무엇을 의미합니까?

첫 번째 숫자는 광범위한 반응 클래스를 나타내고, 두 번째와 세 번째 숫자는 이를 서브클래스 및 서브-서브클래스(일반적으로 관련된 결합 또는 화학 그룹)로 좁히며, 네 번째 숫자는 특정 촉매 반응을 식별하는 일련 번호입니다.

EC 번호가 단일 유전자 또는 단백질을 식별합니까?

아닙니다. EC 번호는 촉매 활동의 이름을 지정하므로, 동일한 번호가 여러 관련 없는 단백질에 적용될 수 있으며, 하나의 단백질이 둘 이상의 반응을 촉매하는 경우 여러 EC 번호를 가질 수 있습니다.