Process / pipelineSingle-cell genomics
RNA Velocity
RNA velocity는 단일 세포 RNA 시퀀싱 데이터로부터 개별 세포의 미래 발달 상태를 추론하는 계산 방법입니다. 2018년 La Manno와 동료들이 개발한 RNA velocity 분석은 개별 세포 내에서 스플라이싱되지 않은(unspliced) mRNA 전사체와 스플라이싱된(spliced) mRNA 전사체의 비율을 분석하여 세포 상태 전이의 방향과 속도를 측정합니다. 이를 통해 시간적 샘플링이나 조작 없이 세포 궤적과 분화 경로를 예측할 수 있으며, 발달 및 질병 과정에서의 세포 운명 결정에 대한 독특한 통찰력을 제공합니다.
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출처
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
이 페이지 인용 방법
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/ko/genetics/rna-velocity
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