Process / pipelineMetagenomics
메타게놈 비닝
메타게놈 비닝은 복잡한 미생물 군집에서 조립된 연속체(contigs)를 개별 유기체 또는 균주를 나타내는 고유한 유전체 빈(genome bins)으로 분할하는 과정입니다. Banfield와 동료들이 개척한 이 파이프라인은 배양된 분리균 없이도 환경 샘플에서 단일 유기체 유전체(메타게놈 조립 유전체 또는 MAGs)를 분리합니다.
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출처
- Kang, D. D., Froula, J., Egan, R., & Wang, Z. (2015). MetaBAT, an efficient tool for accurately reconstructing single genomes from complex microbial communities. PeerJ, 3, e1165. DOI: 10.7717/peerj.1165 ↗
- Jain, C., Rodriguez-R, L. M., Phillippy, A. M., Konstantinidis, K. T., & Aluru, S. (2018). High throughput ANI analysis of 90K prokaryotic genomes reveals clear species boundaries. Nature Communications, 9(1), 4045. DOI: 10.1038/s41467-018-07641-9 ↗
- Sieber, C. M. K., Probst, A. J., Sharrar, A., Thomas, B. C., Hess, M., Tringe, S. G., & Banfield, J. F. (2018). Recovery of genomes from metagenomes via a dereplication, aggregation and scoring strategy. Nature Microbiology, 3(7), 836-843. DOI: 10.1038/s41564-018-0171-1 ↗
이 페이지 인용 방법
ScholarGate. (2026, June 3). Metagenome Assembly and Genome Binning. ScholarGate. https://scholargate.app/ko/bioinformatics/metagenomic-binning
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