Process / pipelineFunctional genomics

CRISPR 스크린 분석

CRISPR 스크린 분석은 CRISPR-Cas9를 사용하여 특정 조건에서 세포 성장, 생존 또는 표현형에 필요한 유전자를 식별하기 위해 풀링된 유전체 스크린에서 얻은 데이터를 처리합니다. Zhang, Sanjana 등이 개발한 이 계산 파이프라인은 가이드 RNA 풍부도의 시퀀싱 판독값을 기능성 유전자의 순위 목록으로 변환합니다.

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출처

  1. Shalem, O., Sanjana, N. E., Hartenian, E., Shi, X., Scott, D. A., Mikkelsen, T. S., ... & Zhang, F. (2014). Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells. Science, 343(6166), 84-87. DOI: 10.1126/science.1247005
  2. Hart, T., Chandrashekhar, M., Aregger, M., Steinhart, Z., Brown, K. R., MacLeod, G., ... & Moffat, J. (2015). High-resolution CRISPR screens reveal fitness genes and pathways. Molecular Systems Biology, 11(8), 820. link
  3. King, J. B., Palmer, A. C., & Sorger, P. K. (2020). Application of a genetic algorithm designed for flexible objective optimization in pharmaceutical research and development. Cancer Research, 79(13 Supplement), 3435. link

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ScholarGate. (2026, June 3). CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification. ScholarGate. https://scholargate.app/ko/bioinformatics/crispr-screen-analysis

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ScholarGateCRISPR Screen Analysis (CRISPR Screening Data Analysis and Hit Identification). 2026-06-15에 다음에서 검색함: https://scholargate.app/ko/bioinformatics/crispr-screen-analysis · 데이터셋: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026