接合菌類とその他の菌類部門

接合菌類は、厚壁の有性胞子である接合胞子を形成することを伝統的に特徴とする、急速に成長する、主に糸状の菌類の歴史的なグループです。分子系統学により、かつての門「接合菌門」は単一の自然な系統ではないことが示されており、そのメンバーはムコール菌門およびいくつかの関連する門に再分類され、菌界の他の初期分岐部門とともに位置づけられています。

Definition

接合菌類は、歴史的に接合胞子の産生によってグループ化された、共生性（大部分が非隔壁性）の糸状菌類です。このグループは現在、非単系統群として認識されており、そのメンバーは単一の接合菌門ではなく、主にムコール菌門および関連する初期分岐門に分布しています。

Scope

このトピックでは、接合菌類および菌界の非ディカリア部門について扱います。歴史的な定義上の特徴としての接合胞子、ゲノム規模の系統学によってグループが解体された理由、および関連する初期分岐系統の位置について説明します。臨床的に注目すべきムコール目（Mucorales）は、主要なMeSHアンカーとして扱われます。この項目は参照用の概要であり、診断や治療に関する指針を提供するものではありません。

Core questions

• 接合胞子とは何か、なぜそれが歴史的な接合菌類を定義したのか？
• なぜ「接合菌門」は自然なグループとして放棄されたのか？
• 旧接合菌類は今日、ムコール菌門および関連する門にどのように分布しているのか？
• 初期分岐菌類部門はディカリアとどのように異なるのか？

Key concepts

• 接合胞子
• 共生性（大部分が非隔壁性）菌糸
• 胞子嚢と胞子嚢胞子
• ムコール目
• ムコール菌門
• 「接合菌門」の非単系統性
• 初期分岐（基底）菌類系統
• 組織内の幅広く、リボン状の非隔壁性菌糸

Mechanisms

古典的な接合菌類は、2つの適合する菌糸が融合すると接合胞子を形成し、通常は胞子嚢内で生成される胞子嚢胞子によって無性生殖を行います。その菌糸は幅広く、ほとんど隔壁がありません（共生性）。ゲノム規模の系統学的分析により、これらの特徴を共有する分類群が単一のクレードを形成しないことが示され、以前のHibbettら（2007）による高次分類体系を洗練し、単一の接合菌門ではなく、ムコール菌門およびいくつかの関連する門への再分類が促されました（Spatafora et al., 2016）。これらの菌類の幅広く、まばらに隔壁のある菌糸は、組織切片において特徴的な外観を与えます（Guarner & Brandt, 2011）。

Clinical relevance

ムコール目のメンバーはムコール症の病原体であり、その生物学はなぜ管理が困難であると認識されているのかを説明するのに役立ちます（Katragkou et al., 2014）。特徴的な幅広く、リボン状で、まばらに隔壁のある菌糸は、組織病理学におけるその認識を助けます（Guarner & Brandt, 2011）。この項目は、これらの菌類を識別可能にする分類と形態を記述するものであり、個別の診断または治療の推奨事項の出典ではありません。

Evidence & guidelines

旧接合菌類の現在の分類は、Hibbettら（2007）による以前の菌界全体の体系に対し、Spataforaら（2016）によるゲノム規模の門レベルの改訂に従っています。ムコール目に関する臨床的および組織病理学的文脈は、GuarnerおよびBrandt（2011）とKatragkouら（2014）から引用されています。

History

20世紀の大部分において、接合菌門は接合胞子を産生する菌類を統合し、ムコール目がその最もよく知られた目でした。DNAベースの系統学が蓄積されるにつれて、このグループはいくつかの異なる系統の人工的な集合体であることが判明しました。Hibbettら（2007）の高次分類はすでにこの不安定性を示唆しており、Spataforaら（2016）のゲノム規模の分析は、「接合菌門」をムコール菌門および関連する門に正式に置き換えました。

Debates

「接合菌門」は有効な門か？

ゲノム規模の系統学は、接合胞子を形成する菌類が他の菌類を除外して単一の共通祖先を共有しないことを示しているため、この門は解体され、そのメンバーはムコール菌門および関連する門に再分類されました。古い名称は非公式に存続しています。

Key figures

• Joseph W. Spatafora
• Gerald L. Benny
• David Hibbett
• Jason E. Stajich

Seminal works

• spatafora-2016
• hibbett-2007

Frequently asked questions

「接合菌門」はまだ認識されている門ですか？

いいえ。ゲノム規模の研究により、それが単一の自然な系統ではないことが示され、そのメンバーは主にムコール菌門およびいくつかの関連する初期分岐門に再分類されましたが、「接合菌類」という用語は非公式に使用され続けています。

接合菌類の菌糸の特徴は何ですか？

それらは典型的には幅広く、共生性であり、隔壁（セプタ）がほとんどまたは全くないことを意味します。これにより、ディカリアの規則的に隔壁のある菌糸と比較して、特徴的な幅広く、リボン状の外観を呈します。