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Process / pipelineSoil and plant microbiome ecology

Rhizosphere Amplicon Analysis — ルートゾーン微生物叢プロファイリング

Rhizosphere Amplicon Analysis(根圏増幅子解析)は、細菌の16S rRNA遺伝子や真菌のITS領域などの標的マーカー遺伝子を配列決定することにより、根に隣接する土壌領域、すなわち根圏に生息する微生物群集を特徴づけるために使用される分子生態学的パイプラインである。農学、土壌生態学、植物病理学に広く応用されており、研究者はどの微生物が存在するか、それらの組成が異なる作物、処理、または土壌条件下でどのように変化するか、そして群集構造が植物の健康と生産性にどのように関連するかを特定できる。

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出典

  1. Lundberg, D. S., Lebeis, S. L., Paredes, S. H., Yourstone, S., Gehring, J., Malfatti, S., ... & Dangl, J. L. (2012). Defining the core Arabidopsis thaliana root microbiome. Nature, 488(7409), 86-90. DOI: 10.1038/nature11237
  2. Berendsen, R. L., Pieterse, C. M., & Bakker, P. A. (2012). The rhizosphere microbiome and plant health. Trends in Plant Science, 17(8), 478-486. DOI: 10.1016/j.tplants.2012.04.001

このページの引用方法

ScholarGate. (2026, June 3). Rhizosphere Amplicon Sequencing and Community Profiling. ScholarGate. https://scholargate.app/ja/agronomy/rhizosphere-amplicon-analysis

ScholarGateRhizosphere Amplicon Analysis (Rhizosphere Amplicon Sequencing and Community Profiling). 2026-06-15に以下より取得 https://scholargate.app/ja/agronomy/rhizosphere-amplicon-analysis · データセット: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026