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Multi-omics single-cell RNA-seq analysis/Evidenza
Record di evidenza del metodo

Multi-omics single-cell RNA-seq analysis

Multi-omics single-cell RNA-seq analysis integrates two or more molecular layers — such as gene expression (scRNA-seq), chromatin accessibility (scATAC-seq), or surface protein abundance (CITE-seq) — measured simultaneously or co-profiled in the same individual cells. By aligning these modalities in a shared low-dimensional space, researchers gain a mechanistically richer picture of cell identity, regulatory state, and phenotype than any single assay can provide.

Sources recorded, not reviewed

Record di origine

Citazioni copiate testualmente dal record di origine del metodo. Non si inferisce alcuna verifica a livello di affermazione da esse.

Multi-omics Single-Cell RNA Sequencing Analysis
Record tassonomico del metodo · process-pipeline / bioinformatics
  • Hao, Y., Hao, S., Andersen-Nissen, E., Mauck, W. M., Zheng, S., Butler, A., Lee, M. J., Wilk, A. J., Darby, C., Zager, M., Hoffman, P., Stoeckius, M., Papalexi, E., Mimitou, E. P., Jain, J., Srivastava, A., Stuart, T., Fleming, L. M., Yeung, B., Rogers, A. J., McElrath, J. M., Blish, C. A., Gottardo, R., Smibert, P., & Satija, R. (2021). Integrated analysis of multimodal single-cell data. Cell, 184(13), 3573–3587.e29. · URL
  • Argelaguet, R., Arnol, D., Bredikhin, D., Deloro, Y., Velten, B., Marioni, J. C., & Stegle, O. (2020). MOFA+: a statistical framework for comprehensive integration of multi-modal single-cell data. Genome Biology, 21(1), 111. · URL
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Affermazioni curate

Affermazioni persistite nel registro delle evidenze, ciascuna con la propria valutazione.

Nessuna affermazione curata ancora

Questa vista non inventa una valutazione dell'affermazione quando il registro non ne ha.

Metodi correlati

Generato dal grafo dei metodi e mostrato come relazioni suggerite dalla macchina — nessuna affermazione di evidenza viene inferita.

Taxonomic bucketChIP-seq Peak Callingmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketGene Set Enrichment Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketMulti-omics RNA-seq differential expressionmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketPathway Enrichment Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketRNA-seq Differential Expressionmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketSingle-cell RNA-seq analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Stato evidenza

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Fonti

2 citazioni registrate, copiate dal record di origine del metodo.

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