Analiza varijacija broja kopija u jedniničnim stanicama
Analiza varijacija broja kopija u jedniničnim stanicama (scCNV) otkriva dobitke i gubitke genomičkih segmenata unutar pojedinačnih stanica, omogućujući istraživačima da razriješe intratumorsku heterogenost, rekonstruiraju klonsku evoluciju i razlikuju maligne od normalnih stanica na rezoluciji pojedinačne stanice. Može se primijeniti izravno na podatke sekvenciranja cijelog genoma jedniničnih stanica ili se može izvesti iz signala dubine čitanja u eksperimentima scRNA-seq ili scATAC-seq.
Pročitajte cijelu metodu
Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.
Karta metoda
Okruženje srodnih metoda — odaberite čvor za istraživanje.
Izvori
- Garvin, T., Aboukhalil, R., Kendall, J., Baslan, T., Atwal, G. S., Hicks, J., Wigler, M., & Schatz, M. C. (2015). Interactive analysis and assessment of single-cell copy-number variations. Nature Methods, 12(11), 1058–1060. link ↗
- Gao, R., Bai, S., Henderson, Y. C., Lin, Y., Schalck, A., Yan, Y., Kumar, T., Hu, M., Sei, E., Davis, A., Wang, F., Shaitelman, S. F., Wang, J. R., Chen, K., Moulder, S., Lai, S. Y., & Navin, N. E. (2021). Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell transcriptomes. Nature Biotechnology, 39(5), 599–608. link ↗
Kako citirati ovu stranicu
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/single-cell-copy-number-variation-analysis
Koja metoda?
Postavite ovu metodu uz njoj najsrodnije i pročitajte ih jednu uz drugu — knjižnica vam knjige stavlja na stol; izbor je na vama.
- Analiza varijacija broja kopijaBioinformatika↔ usporedi
- Studija udruživanja epigenoma na pojedinačnim stanicama (scEWAS)Bioinformatika↔ usporedi
- Jednoćelijska GWASBioinformatika↔ usporedi
- Analiza RNA-sekvencije pojedinačnih stanicaBioinformatika↔ usporedi
- Analiza diferencijalne ekspresije u jediničnim stanicama (scRNA-seq DE)Bioinformatika↔ usporedi
- Pozivanje varijantiBioinformatika↔ usporedi
Citirana u
Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →