ScholarGate
Asistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Pozivanje vrhunaca ChIP-seq — Pozivanje vrhunaca imunoprecipitacije kromatina sekvenciranjem

Pozivanje vrhunaca ChIP-seq je računalni cjevovod koji identificira genomska područja gdje je obogaćen protein od interesa — transkripcijski faktor ili modifikacija histona — na temelju sekvencijskih čitanja iz eksperimenata imunoprecipitacije kromatina. Pretvara sirove podatke sekvenciranja u skupinu lokacija vezanja ili modifikacije s visokom pouzdanošću diljem genoma, omogućujući naknadnu analizu regulacije gena, stanja kromatina i epigenetičkih mehanizama.

Otvorite u MethodMindUskoroVideoUskoroDownload slides

Pročitajte cijelu metodu

Samo za članove

Prijavite se besplatnim računom kako biste pročitali ovaj odjeljak.

Prijavite se

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Pozivanje vrhunaca ChIP-seq
Analiza ATAC-sekvenciran…Analiza povezanosti na r…RNA-seq diferencijalna e…Poravnavanje sekvenciAnaliza RNA-sekvencije p…Pozivanje varijantiBayesian ChIP-seq poziva…Diferencijalno pozivanje…Diferencijalna studija p…Pozivanje vrhunaca pomoć…

+3 more

Izvori

  1. Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C. A., Eeckhoute, J., Johnson, D. S., Bernstein, B. E., Nusbaum, C., Myers, R. M., Brown, M., Li, W., & Liu, X. S. (2008). Model-based analysis of ChIP-seq (MACS). Genome Biology, 9(9), R137. DOI: 10.1186/gb-2008-9-9-r137 ↗
  2. Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., Bernstein, B. E., Bickel, P., Brown, J. B., Cayting, P., Chen, Y., DeSalvo, G., Epstein, C., Fisher-Aylor, K. I., Euskirchen, G., Gerstein, M., Gertz, J., Hartemink, A. J., Hoffman, M. M., ... Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗

Kako citirati ovu stranicu

ScholarGate. (2026, June 3). Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/hr/bioinformatics/chip-seq-peak-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side →

Citirana u

Bayesian ChIP-seq pozivanje vrhunacaDiferencijalno pozivanje ChIP-seq vrhovaDiferencijalna studija povezanosti epigenoma (Differential EWAS)Analiza povezanosti na razini epigenoma (EWAS)Pozivanje vrhunaca pomoću potpomognutog strojnog učenja za ChIP-seqMulti-omics single-cell RNA-seq analysisRNA-seq diferencijalna ekspresijaPoravnavanje sekvenciPozivanje vrhunaca kod jednaničnih stanica ChIP-seqAnaliza poziva vrhunaca ChIP-seq vremenskih nizova

Uočili ste pogrešku na ovoj stranici? Prijavite je ili predložite ispravak →

ScholarGate — ChIP-seq Peak Calling (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling). Preuzeto 2026-06-15 s https://scholargate.app/hr/bioinformatics/chip-seq-peak-calling · Skup podataka: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026