Validation des tests et évaluation de la performance

La validation des tests et l'évaluation de leur performance constituent l'ensemble des travaux par lesquels un test moléculaire est démontré comme mesurant ce qu'il prétend mesurer, de manière reproductible, et comme étant apte à l'usage clinique auquel il est destiné. Elle distingue la validation analytique (l'essai mesure-t-il correctement l'analyte ?) de la validation clinique (le résultat reflète-t-il l'état clinique ?), et quantifie la performance à l'aide de métriques telles que l'exactitude, la précision, la sensibilité, la spécificité et les limites de détection.

Definition

La validation des tests est le processus documenté qui démontre, par des expériences systématiques, qu'un test de laboratoire fonctionne avec exactitude et reproductibilité et qu'il est adapté à son objectif clinique prévu ; l'évaluation de la performance est la mesure et la vérification continues de ces caractéristiques.

Scope

Cette entrée aborde les concepts et les métriques utilisés pour établir et documenter la performance des tests moléculaires avant leur utilisation clinique et pour la vérifier par la suite : la validité analytique versus clinique, les caractéristiques de performance standard, et les considérations spéciales pour les essais de haute complexité et leurs pipelines bioinformatiques. Il s'agit d'un sujet méthodologique qui ne fournit aucune instruction pour le diagnostic ou le traitement des patients.

Core questions

• Quelle est la différence entre la validité analytique et la validité clinique ?
• Quelles caractéristiques de performance doivent être établies pour un test moléculaire ?
• Comment les limites de détection et de quantification sont-elles déterminées ?
• Comment le séquençage et le pipeline bioinformatique sont-ils validés, et pas seulement l'essai en laboratoire ?

Key concepts

• Validité analytique
• Validité clinique
• Exactitude et justesse
• Précision (répétabilité et reproductibilité)
• Sensibilité analytique et limite de détection
• Spécificité analytique
• Plage de résultats rapportables et mesurables
• Validation du pipeline bioinformatique
• Adéquation à l'usage prévu

Mechanisms

La validation s'effectue par des expériences conçues à l'aide d'échantillons caractérisés. L'exactitude est évaluée par comparaison à une méthode de référence ou à des échantillons connus ; la précision par des mesures répétées dans des conditions de répétabilité et de reproductibilité ; la sensibilité analytique par la détermination de la limite de détection ; et la spécificité analytique par le test des interférences et de la réactivité croisée (Jennings et al., 2009). Les essais moléculaires quantitatifs peuvent être validés avec le même cadre de chimie clinique utilisé pour d'autres mesurandes, comme démontré pour les essais de biopsie liquide par PCR numérique en gouttelettes (Milosevic et al., 2018). Pour le séquençage de nouvelle génération, le pipeline computationnel qui identifie et filtre les variants doit être validé parallèlement aux étapes de laboratoire (Roy et al., 2018). La validité clinique, distincte de ces aspects, évalue la capacité du résultat à classer correctement la condition clinique.

Clinical relevance

La fiabilité d'un résultat moléculaire dans le cadre des soins aux patients repose sur le travail de validation et de performance qui le sous-tend ; des caractéristiques de performance non documentées ou faibles compromettent l'interprétation. Cette entrée explique comment les laboratoires établissent cette confiance et ne constitue pas un guide pour la prescription ou l'action basée sur des tests spécifiques.

Evidence & guidelines

La pratique de la validation est codifiée dans des lignes directrices professionnelles, y compris les principes AMP/CAP pour la validation des tests de pathologie moléculaire et des pipelines de séquençage (Jennings et al., 2009 ; Roy et al., 2018) et les documents de consensus du CLSI (CLSI EP28). Ceux-ci fournissent les plans expérimentaux et les critères d'acceptation que les laboratoires suivent dans le cadre de l'accréditation.

History

À mesure que les tests moléculaires cliniques se sont développés, les organisations professionnelles ont adapté les principes de validation établis en chimie clinique et en médecine de laboratoire aux essais moléculaires, puis les ont étendus au séquençage massivement parallèle et à sa bioinformatique, produisant ainsi les normes de validation stratifiées utilisées aujourd'hui (Jennings et al., 2009 ; Roy et al., 2018).

Debates

Comment la validation doit-elle s'adapter aux essais multi-cibles de haute complexité ?

Établir la performance pour chaque variant possible détectable par des panels de séquençage étendus est peu pratique, de sorte que les lignes directrices s'appuient sur une validation représentative et la validation du pipeline ; la question de savoir ce qui est suffisant demeure un sujet de discussion actif.

Seminal works

• jennings-2009
• roy-2018

Frequently asked questions

Quelle est la différence entre la validité analytique et la validité clinique ?

La validité analytique concerne la capacité de l'essai à mesurer l'analyte avec exactitude et reproductibilité ; la validité clinique concerne la correspondance réelle du résultat avec la condition clinique que le test est censé détecter.

Pourquoi le séquençage de nouvelle génération nécessite-t-il une validation du pipeline ?

Étant donné que les variants rapportés dépendent du logiciel qui aligne les lectures et identifie les variants, le pipeline bioinformatique peut introduire des erreurs et doit être validé parallèlement à la procédure de laboratoire.