همهگیرشناسی و انتقال ویروسی
همهگیرشناسی و انتقال ویروسی به مطالعه چگونگی پیدایش، گسترش و پایداری عفونتهای ویروسی در داخل و بین جمعیتهای میزبان میپردازد. این حوزه، زیستشناسی نحوه حرکت ویروسهای منفرد از یک میزبان به میزبان دیگر را با الگوهای جمعیتی که این حرکتها ایجاد میکنند، از عفونتهای پراکنده تا اپیدمیها و پاندمیها، پیوند میدهد و مفاهیم کمی مورد استفاده برای توصیف و مقایسه گسترش بیماریهای ویروسی را ارائه میدهد.
Definition
همهگیرشناسی و انتقال ویروسی شاخهای از همهگیرشناسی و ویروسشناسی است که به توزیع، تعیینکنندهها و دینامیک عفونتهای ویروسی در جمعیتها، و مکانیسمهایی که ویروسها از طریق آنها بین میزبانها منتقل میشوند، میپردازد.
Scope
این حوزه مفاهیم اصلی را که گسترش ویروسی را در مقیاس جمعیتی توصیف میکنند، گردآوری میکند: مسیرهایی که ویروسها از طریق آنها بین میزبانها حرکت میکنند، زمانبندی عفونتزایی نسبت به علائم، پارامترهای خلاصهکننده که قابلیت انتقال را کمیسازی میکنند مانند عدد تکثیر پایه و نرخ حمله، نقش ساختار جمعیت و ایمنی انباشته شده، و دینامیک اپیدمیها و پاندمیها. این مفاهیم را به عنوان مفاهیم مرجع در ویروسشناسی و همهگیرشناسی بیماریهای عفونی چارچوببندی میکند و توصیههای بالینی یا بهداشت عمومی ارائه نمیدهد.
Sub-topics
Core questions
- یک ویروس معین از چه مسیرهایی از یک میزبان به میزبان دیگر منتقل میشود؟
- در چه زمانی از عفونت، یک میزبان قادر به انتقال ویروس است و برای چه مدت؟
- یک ویروس چقدر قابل انتقال است و این قابلیت انتقال چگونه به صورت کمی خلاصه میشود؟
- ساختار جمعیت و ایمنی انباشته شده چگونه شکلگیری یا فروکش کردن یک شیوع را تعیین میکنند؟
- چه چیزی دینامیک یک اپیدمی را از دینامیک یک پاندمی متمایز میکند؟
Key concepts
- مسیرهای انتقال ویروسی
- دوره عفونتزایی و دوره نهفتگی
- عدد تکثیر پایه (R0) و عدد تکثیر مؤثر (Rt)
- نرخ حمله و نرخ حمله ثانویه
- ایمنی گله و آستانه ایمنی گله
- دینامیک اپیدمی و پاندمی
- چارچوب مستعد-عفونی-بهبودیافته (محفظهای)
Mechanisms
گسترش ویروسی در سطح جمعیت از زنجیرهای از رویدادهای انتقال فردی نشأت میگیرد. ویروس از یک میزبان آلوده آزاد میشود (به عنوان مثال در قطرات تنفسی، آئروسلها، مایعات بدن یا مدفوع)، برای مدتی در یک محیط یا روی آن زنده میماند و از طریق یک مسیر سازگار به یک میزبان مستعد میرسد. اینکه آیا چنین رویدادهایی به گسترش پایدار منجر میشوند، بستگی به این دارد که هر مورد به طور متوسط چند عفونت ثانویه تولید میکند، که توسط عدد تکثیر (reproduction number) نشان داده میشود، و این به نوبه خود منعکسکننده قابلیت انتقال ویروس، مدت و زمانبندی عفونتزایی، و تعداد تماسهای مستعد موجود است. با کاهش جمعیت مستعد از طریق عفونت یا واکسیناسیون، عدد تکثیر مؤثر کاهش مییابد و رشد را کند کرده و در نهایت معکوس میکند.
Clinical relevance
مفاهیم این حوزه زیربنای چگونگی شناسایی، توصیف و مقایسه شیوع بیماریهای ویروسی هستند و استدلال پشت استراتژیهای نظارتی، غیردارویی و ایمنسازی را شکل میدهند. آنها در اینجا برای توضیح چگونگی مشخص شدن گسترش ویروسی در سطح جمعیت ارائه شدهاند؛ آنها استدلال اپیدمیولوژیک را توصیف میکنند تا تصمیمات تشخیصی یا درمانی فردی را.
Epidemiology
عفونتهای ویروسی از شرایط بومی که به طور مداوم در گردش هستند تا اپیدمیهای انفجاری و پاندمیهای جهانی را شامل میشوند. ویروسهای تنفسی مانند آنفولانزا و SARS-CoV-2 طیف وسیعی از قابلیت انتقال و اهمیت عفونتزایی پیشعلامتی را نشان میدهند، در حالی که مطالعه تطبیقی اعداد تکثیر و نرخهای حمله در میان عوامل بیماریزا، چارچوب مشترکی برای درک اینکه چرا برخی ویروسها بسیار راحتتر از دیگران گسترش مییابند، فراهم میکند.
History
مطالعه کمی گسترش بیماریهای عفونی از مدلهای ریاضی اوایل قرن بیستم آغاز شد و در نیمه دوم قرن با توسعه و کاربرد مدلهای محفظهای (compartmental models) و چارچوب عدد تکثیر (reproduction-number framework) به بلوغ رسید. سنتز اندرسون و می در سال 1991 رویکرد دینامیک جمعیت را تثبیت کرد، و اپیدمیها و پاندمیهای متوالی، از جمله آنفولانزا و SARS-CoV-2، بارها این ابزارها را آزمایش و اصلاح کردند.
Key figures
- Roy Anderson
- Robert May
- Paul Fine
Related topics
Seminal works
- anderson-may-1991
- fine-1993
Frequently asked questions
- همهگیرشناسی ویروسی چه تفاوتی با ویروسشناسی دارد؟
- ویروسشناسی به مطالعه زیستشناسی ویروسها و تعامل آنها با میزبانهای فردی میپردازد، در حالی که همهگیرشناسی ویروسی به مطالعه چگونگی توزیع و گسترش عفونتهای ویروسی در جمعیتها میپردازد؛ این دو در مطالعه انتقال به هم میرسند، که عفونتزایی فردی را به الگوهای سطح جمعیت متصل میکند.
- کدام عدد به بهترین وجه گسترش یک ویروس را خلاصه میکند؟
- هیچ عدد واحدی همه چیز را در بر نمیگیرد، اما عدد تکثیر پایه (R0) پرکاربردترین خلاصه قابلیت انتقال ذاتی است؛ این عدد با عدد تکثیر مؤثر، نرخ حمله، و توصیف مسیر و زمانبندی انتقال تکمیل میشود.