Cladística y Parsimonia
La parsimonia cladística elige el árbol evolutivo que explica los caracteres observados con el menor número de cambios, tratando la homoplasia como el costo a minimizar.
Definition
La parsimonia máxima es un criterio de optimización que selecciona el árbol filogenético que minimiza el número total de cambios de estado de carácter requeridos para explicar los datos.
Scope
Este tema abarca el criterio de optimización de parsimonia, el recuento de cambios de estado de carácter (longitud del árbol), las estrategias de búsqueda para encontrar los árboles más cortos, los métodos de consenso para resumir múltiples árboles igualmente parsimoniosos, y los supuestos y críticas de la parsimonia como base para la inferencia filogenética.
Core questions
- ¿Cómo se calcula la longitud de un árbol bajo parsimonia?
- ¿Cómo se encuentran los árboles más cortos cuando la búsqueda exhaustiva es imposible?
- ¿Cómo se resumen múltiples árboles igualmente parsimoniosos?
- ¿Bajo qué condiciones puede la parsimonia ser engañada?
Key theories
- Principio de cambio mínimo
- La parsimonia prefiere el árbol que requiere el menor número de cambios evolutivos, bajo la lógica de que las hipótesis ad hoc de homoplasia deben minimizarse.
- Atracción de ramas largas
- La parsimonia puede ser estadísticamente inconsistente, agrupando linajes que evolucionan rápidamente debido a cambios convergentes en lugar de ascendencia compartida, un modo de fallo conocido como atracción de ramas largas.
Clinical relevance
Los árboles basados en parsimonia siguen siendo ampliamente utilizados para conjuntos de datos morfológicos y combinados, incluidos los análisis con fósiles, que contribuyen a nuestra comprensión de la evolución de los rasgos relevantes para la biología comparada y la biomedicina.
History
La parsimonia se convirtió en el método computacional dominante de la era cladística, implementado en software ampliamente utilizado desde la década de 1980 en adelante; la demostración de Felsenstein de que la parsimonia puede ser inconsistente bajo tasas desiguales impulsó el surgimiento de alternativas basadas en modelos.
Debates
- Si la parsimonia o la verosimilitud es preferible
- Los defensores de la parsimonia enfatizan sus suposiciones mínimas y su transparencia, mientras que los críticos señalan su inconsistencia estadística bajo tasas heterogéneas y favorecen métodos explícitamente basados en modelos.
Key figures
- Willi Hennig
- Joseph Felsenstein
- James Farris
Related topics
Seminal works
- hennig1966
- wiley2011
- felsenstein2004
Frequently asked questions
- ¿Por qué minimizar el número de cambios evolutivos?
- La parsimonia trata cada cambio adicional como una suposición ad hoc adicional de homoplasia, por lo que el árbol más corto se considera la explicación mejor respaldada de los datos.
- ¿Qué es la atracción de ramas largas?
- Es un artefacto en el que dos linajes no relacionados y de evolución rápida se agrupan porque las similitudes convergentes casuales se confunden con ascendencia compartida, una debilidad conocida de la parsimonia.