Proteínas Antiguas y Paleoproteómica
La paleoproteómica analiza proteínas antiguas conservadas en huesos, dientes, cálculo dental y artefactos, recuperando información sobre especies, dieta, enfermedades y sexo, a veces mucho más allá de los límites de supervivencia del ADN.
Definition
El estudio de proteínas antiguas que sobreviven en restos arqueológicos, utilizando espectrometría de masas para identificar especies, reconstruir la dieta y enfermedades, estimar el sexo y recuperar información biológica cuando el ADN está ausente.
Scope
Este tema cubre el estudio de proteínas antiguas basado en espectrometría de masas: identificación de especies a partir de péptidos de colágeno (ZooMS), reconstrucción de la dieta y enfermedades a partir de proteomas de cálculo dental, estimación del sexo a partir de péptidos de amelogenina del esmalte, y el uso de proteínas en contextos de tiempo profundo donde el ADN no sobrevive. Aborda la preservación, la contaminación y la complementariedad de proteínas y ADN.
Core questions
- ¿Cómo se recuperan e identifican las proteínas antiguas mediante espectrometría de masas?
- ¿Cómo identifica la huella de masas de péptidos de colágeno las especies a partir de huesos fragmentados?
- ¿Qué revelan los proteomas del cálculo dental sobre la dieta y el microbioma oral?
- ¿Cuándo las proteínas perduran más que el ADN, y qué pueden recuperar en el tiempo profundo?
Key theories
- Las proteínas como archivo biomolecular de tiempo profundo
- El principio de que las proteínas, especialmente las estructurales como el colágeno y las proteínas del esmalte, pueden sobrevivir más tiempo que el ADN, extendiendo la inferencia biomolecular a períodos de tiempo y condiciones donde el ADN antiguo no se preserva.
- El cálculo dental como reservorio proteómico
- La demostración de Warinner y sus colegas de que la placa dental mineralizada atrapa proteínas del huésped, microbianas y dietéticas, haciendo del cálculo un rico archivo de la dieta pasada, patógenos orales y respuesta inmune.
History
El estudio de proteínas antiguas pasó del trabajo con aminoácidos y colágeno a la paleoproteómica moderna con la difusión de la espectrometría de masas de alta sensibilidad después de aproximadamente 2010. La huella peptídica de colágeno (ZooMS) se convirtió en una herramienta rutinaria para la identificación de especies, el cálculo dental emergió como un importante archivo proteómico, y las proteínas se utilizaron para recuperar información en contextos donde el ADN se había degradado.
Debates
- Fiabilidad y alcance de las afirmaciones sobre proteínas antiguas
- Cómo autenticar proteínas antiguas frente a la contaminación moderna y los artefactos de degradación, y hasta qué punto las secuencias de proteínas muy antiguas pueden respaldar la inferencia filogenética y dietética en relación con la evidencia de ADN mejor validada.
Key figures
- Christina Warinner
- Matthew J. Collins
- Enrico Cappellini
- Jessica Hendy
Related topics
Seminal works
- hendyetal2018
- warinneretal2014
- cappellinietal2018
Frequently asked questions
- ¿Cómo pueden sobrevivir las proteínas cuando el ADN no lo hace?
- Algunas proteínas, especialmente las estructurales unidas dentro del hueso y el esmalte, son más estables químicamente que el ADN, por lo que pueden persistir en material más antiguo o conservado en condiciones más duras y aún ser identificadas por espectrometría de masas.
- ¿Qué es ZooMS?
- ZooMS, o zooarqueología por espectrometría de masas, identifica la especie animal de un fragmento de hueso a partir de las masas de sus péptidos de colágeno, permitiendo la identificación de fragmentos demasiado pequeños o rotos para ser reconocidos por su forma.