Diagnóstico de Laboratorio y Técnicas de Cultivo
El diagnóstico de laboratorio y las técnicas de cultivo son los métodos mediante los cuales el laboratorio de microbiología clínica detecta, cultiva e identifica las bacterias responsables de una infección. Esta área orienta al lector a lo largo de todo el proceso diagnóstico, desde cómo se recolecta y transporta una muestra hasta cómo se cultiva, nombra y confirma un organismo por medios fenotípicos o moleculares, junto con los sistemas de calidad que hacen que esos resultados sean fiables.
Definition
El diagnóstico de laboratorio y las técnicas de cultivo comprenden los métodos analíticos y preanalíticos utilizados en bacteriología clínica para recuperar, identificar y caracterizar patógenos bacterianos a partir de muestras clínicas, abarcando el cultivo, la identificación fenotípica, la detección molecular y el aseguramiento de la calidad.
Scope
Esta área examina los componentes del diagnóstico bacteriológico como un flujo de trabajo interconectado: selección y procesamiento adecuados de las muestras, medios de cultivo y condiciones de incubación que permiten recuperar organismos, identificación fenotípica y basada en espectrometría de masas, amplificación de ácidos nucleicos y otros diagnósticos moleculares, y control de calidad de laboratorio. Se presentan estos como conceptos de referencia para comprender cómo se genera la evidencia de laboratorio, no como un manual para solicitar o interpretar pruebas en un paciente individual.
Sub-topics
Core questions
- ¿Cómo recupera el laboratorio un patógeno bacteriano de una muestra clínica?
- ¿Qué determina si un organismo cultivado es un patógeno, un colonizador o un contaminante?
- ¿Cómo se identifican las bacterias una vez recuperadas, y qué métodos más recientes complementan o reemplazan el cultivo?
- ¿Qué sistemas de calidad aseguran que los resultados microbiológicos sean precisos y reproducibles?
Key concepts
- Fases preanalítica, analítica y postanalítica
- Medios de cultivo y condiciones de incubación
- Identificación fenotípica
- Espectrometría de masas de tiempo de vuelo con desorción/ionización láser asistida por matriz (MALDI-TOF)
- Pruebas de amplificación de ácidos nucleicos
- Calidad de la muestra y contaminación
- Control de calidad de laboratorio y pruebas de aptitud
Mechanisms
El diagnóstico bacteriológico se desarrolla a lo largo de un flujo de trabajo cuya validez depende de cada paso. Se recolecta y transporta una muestra representativa del sitio de la infección bajo condiciones que preservan los organismos viables, luego se inocula en medios y se incuba en atmósferas adecuadas para los patógenos sospechosos. Se examina el crecimiento y los aislados se identifican mediante reacciones fenotípicas o, cada vez más, por espectrometría de masas MALDI-TOF; los métodos moleculares pueden detectar organismos directamente de las muestras sin cultivo previo. En todo momento, los procedimientos de control de calidad verifican que los medios, reactivos e instrumentos funcionan como se espera, de modo que un resultado informado refleje al paciente y no un artefacto de laboratorio. Las guías autorizadas enmarcan al laboratorio y al clínico como socios cuyas decisiones conjuntas sobre qué recolectar y analizar determinan el rendimiento diagnóstico (Baron 2013).
Clinical relevance
Los resultados producidos por estos métodos sustentan gran parte de la evidencia utilizada para atribuir infecciones a organismos específicos y para rastrear la resistencia. Comprender la vía diagnóstica ayuda a los lectores a evaluar por qué un cultivo puede ser negativo a pesar de la infección, por qué un cultivo positivo puede representar contaminación y cómo las herramientas moleculares y proteómicas más recientes cambian el tiempo de respuesta diagnóstico. Esta área describe cómo se genera la evidencia de laboratorio y no constituye una base para decisiones diagnósticas o de tratamiento individuales.
Evidence & guidelines
Las guías de consenso de la Infectious Diseases Society of America y la American Society for Microbiology describen la selección adecuada de muestras y la utilización del laboratorio para el diagnóstico de enfermedades infecciosas (Baron 2013). Textos de referencia como el Manual of Clinical Microbiology codifican los métodos estándar de cultivo e identificación (Jorgensen 2015), y diversas revisiones han trazado el cambio hacia diagnósticos moleculares y proteómicos más rápidos (Caliendo 2013).
History
La bacteriología diagnóstica surgió de los métodos de cultivo de finales del siglo XIX de los primeros microbiólogos y maduró a lo largo del siglo XX hasta convertirse en esquemas fenotípicos estandarizados. Finales del siglo XX y principios del XXI trajeron la amplificación de ácidos nucleicos y la espectrometría de masas MALDI-TOF, que redujeron los tiempos de identificación y, en algunos entornos, permitieron la detección sin cultivo (Caliendo 2013).
Related topics
Seminal works
- baron-2013
- jorgensen-2015
- caliendo-2013
Frequently asked questions
- ¿Qué hace realmente el laboratorio de microbiología clínica?
- Recupera, identifica y caracteriza microorganismos de muestras clínicas, utilizando cultivo, identificación fenotípica y molecular, y sistemas de calidad para que los resultados reflejen de manera fiable lo que está presente en el paciente.
- ¿Sigue siendo necesario el cultivo ahora que existen las pruebas moleculares?
- El cultivo sigue siendo fundamental porque permite recuperar un aislado viable para pruebas adicionales, pero los métodos moleculares y de espectrometría de masas lo complementan cada vez más al acelerar la identificación y, para algunos objetivos, detectar organismos directamente de las muestras.