Taxonomía e Identificación Fúngica
La taxonomía e identificación fúngica es la rama de la micología que se ocupa de cómo se clasifican los hongos en una jerarquía evolutiva coherente y cómo se reconocen y nombran los aislados individuales. Abarca la división de alto nivel del reino fúngico en filos como Ascomycota y Basidiomycota, las características morfológicas y moleculares utilizadas para diferenciar los taxones, y los flujos de trabajo prácticos mediante los cuales se identifica un hongo clínico o ambiental.
Definition
La taxonomía fúngica es la clasificación sistemática y la denominación de los hongos dentro de un marco evolutivo, mientras que la identificación fúngica es el proceso de asignar un aislado desconocido a un taxón conocido utilizando caracteres morfológicos, bioquímicos y moleculares.
Scope
Esta área orienta al lector hacia la clasificación moderna del reino Fungi y hacia los métodos utilizados para identificar hongos a nivel de género y especie. Introduce tres temas: las dos divisiones más grandes (Ascomycota y Basidiomycota), los hongos cigomicetos y otras divisiones, y los métodos de identificación morfológica y molecular que sustentan tanto la taxonomía como la micología diagnóstica. Se trata de una visión general de referencia, no de un protocolo de diagnóstico o tratamiento.
Sub-topics
Core questions
- ¿Cómo se divide el reino Fungi en filos y cómo la filogenética molecular ha remodelado esa división?
- ¿Qué estructuras morfológicas y reproductivas distinguen a los principales grupos fúngicos?
- ¿Cómo se identifican los hongos clínicos y ambientales, y dónde se aplican la morfología, la secuenciación y la espectrometría de masas?
- ¿Por qué se han revisado agrupaciones más antiguas como los 'cigomicetos' y el grupo de formas 'Fungi imperfecti'?
Key concepts
- Reino Fungi y sus filos
- Ascomycota y Basidiomycota
- Hongos cigomicetos (Mucoromycota y linajes afines)
- Identificación morfológica (hifas, esporas, estructuras fructíferas)
- Código de barras de ADN y la región ITS
- Filogenética molecular
- Teleomorfo, anamorfo y el paso a un hongo, un nombre
- Identificación por espectrometría de masas MALDI-TOF
Mechanisms
La clasificación se basa en relaciones evolutivas inferidas: la ascendencia compartida se reconstruye a partir de caracteres morfológicos (por ejemplo, el tipo de cuerpo fructífero sexual) y, cada vez más, a partir de datos de secuencias de ADN, de modo que los grupos nombrados corresponden a linajes monofiléticos siempre que sea posible. Hibbett y sus colegas (2007) sintetizaron la evidencia molecular y morfológica en una clasificación de alto nivel del reino, y la región del espaciador transcrito interno (ITS) fue adoptada como un código de barras de ADN universal para los hongos (Schoch et al., 2012), lo que confiere a la identificación una moneda común basada en secuencias que complementa la microscopía y el cultivo tradicionales.
Clinical relevance
La identificación precisa es fundamental para la micología diagnóstica, ya que el género y la especie de un hongo informan sobre su comportamiento esperado y su manejo en el laboratorio, y la histopatología sigue siendo una herramienta central para reconocer elementos fúngicos en los tejidos (Guarner & Brandt, 2011). Esta área describe cómo se nombran y reconocen los hongos y cómo ese conocimiento apoya el diagnóstico de laboratorio; no es una fuente de instrucciones diagnósticas o terapéuticas individuales.
Evidence & guidelines
El marco de referencia para esta área es la clasificación molecular-filogenética del reino Fungi consolidada por Hibbett et al. (2007) y la síntesis Deep Hypha (Blackwell et al., 2006), junto con el estándar de código de barras ITS (Schoch et al., 2012). La identificación diagnóstica se basa adicionalmente en revisiones histopatológicas y de laboratorio como las de Guarner y Brandt (2011).
History
La clasificación fúngica temprana se basó en estructuras reproductivas visibles, dividiendo los hongos por la forma en que producían esporas sexuales y agrupando las formas asexuales por separado como los llamados Fungi imperfecti. Desde finales del siglo XX en adelante, la secuenciación de ADN permitió probar directamente las relaciones evolutivas; la iniciativa Deep Hypha (Blackwell et al., 2006) y la clasificación de alto nivel de Hibbett et al. (2007) reorganizaron el reino siguiendo líneas filogenéticas, y el código de barras ITS (Schoch et al., 2012) estandarizó la identificación molecular.
Key figures
- David Hibbett
- Meredith Blackwell
- John W. Taylor
- Conrad Schoch
Related topics
Seminal works
- hibbett-2007
- schoch-2012
- blackwell-2006
Frequently asked questions
- ¿Cuáles son las principales divisiones del reino fúngico?
- Las dos más grandes son Ascomycota (hongos de saco) y Basidiomycota (hongos de club); linajes adicionales incluyen los hongos cigomicetos ahora ubicados en Mucoromycota y filos afines, junto con grupos de divergencia temprana como los Chytridiomycota.
- ¿Cómo se identifican los hongos en el laboratorio?
- La identificación combina la morfología bajo el microscopio, las características de cultivo y los métodos moleculares como la secuenciación de ITS, utilizándose cada vez más la espectrometría de masas para una identificación rápida; la combinación apropiada depende del organismo y del entorno.