Differential ChIP-seq Peak Calling — Komparativ analyse af kromatinbinding

Differential ChIP-seq peak calling identificerer genomiske loci, hvor et protein af interesse — typisk en transkriptionsfaktor eller en histonmarkør — udviser signifikant ændret binding eller okkupans mellem to eller flere biologiske tilstande. Ved at kombinere standard ChIP-seq peakdetektion med tællingsbaseret statistisk testning afslører metoden tilstandsspecifikke regulatoriske elementer og giver et genom-bredt kort over dynamiske kromatininteraktioner, der ligger til grund for ændringer i cellulære tilstande.