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多重假设检验

当同时检验多个假设时,假阳性会累积;多重检验程序以牺牲部分功效为代价来控制总体错误。

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Definition

多重假设检验是同时检验多个假设,并采用控制全局错误标准(例如任何错误拒绝的概率或错误拒绝的预期比例)的程序。

Scope

本主题涵盖多重性问题和假阳性膨胀、家族错误率及其控制程序(如Bonferroni、Holm和Sidak)、错误发现率和Benjamini-Hochberg程序、弱控制和强控制之间的区别、检验之间的依赖性,以及大规模检验中错误控制与检测功效之间的权衡。

Core questions

  • 为什么检验许多假设会增加至少一个假阳性的几率?
  • Bonferroni和Holm程序如何控制家族错误率?
  • 什么是错误发现率,Benjamini-Hochberg程序如何控制它?
  • 检验之间的依赖性如何影响这些保证?

Key theories

家族错误率控制
Bonferroni程序通过在检验之间分配显著性水平来限制任何错误拒绝的概率;Holm逐步程序以更大的功效实现相同的控制。
错误发现率和Benjamini-Hochberg
错误发现率不是阻止任何错误拒绝,而是控制错误拒绝的预期比例;Benjamini-Hochberg逐步程序控制它,并且对于大量检验而言功效要大得多。

Clinical relevance

多重检验控制在全基因组关联研究、神经影像学和高通量筛选中至关重要,在这些领域中,需要同时检验数千个假设,并且错误发现率方法决定了哪些发现被报告为结果。

History

对多重比较的关注可以追溯到Tukey和二十世纪中叶的同时推断工作。Holm于1979年引入了他的逐步家族错误率控制程序,Benjamini和Hochberg于1995年发表的错误发现率论文改变了大规模检验。

Debates

家族错误率与错误发现率
控制任何错误拒绝的概率是保守的,会牺牲功效,而控制错误发现的预期比例则功效更大,但容忍一些假阳性;哪个标准合适取决于应用中错误的成本。

Key figures

  • Yoav Benjamini
  • Yosef Hochberg
  • Sture Holm
  • John W. Tukey

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Seminal works

  • benjaminiHochberg1995

Frequently asked questions

为什么不直接对每个检验使用通常的显著性水平?
因为在许多检验中,至少一个真实原假设被拒绝的几率会迅速增加;例如,在5%的水平下进行20个独立检验,产生假阳性的几率大约为64%。
错误发现率总是优于Bonferroni吗?
并非总是如此。错误发现率在许多检验中提供更大的功效,但容忍一些错误发现;当即使一个假阳性代价高昂时,则优先选择Bonferroni或Holm等家族错误率控制方法。

Methods for this concept

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