接合菌和其它真菌门

接合菌是一个历史性的分类群，由快速生长、多为丝状的真菌组成，传统上通过形成厚壁的有性孢子（称为接合孢子）来定义。分子系统发育学研究表明，旧的“接合菌门”（Zygomycota）并非单一的自然谱系，其成员已被重新划分为毛霉菌门（Mucoromycota）和几个相关门，以及真菌界中其他早期分化的类群。

Definition

接合菌是合胞体（大部分无隔膜）丝状真菌，历史上因其产生接合孢子而归为一类；该分类群现已被认为是非单系群，其成员主要分布在毛霉菌门和相关早期分化门中，而非单一的接合菌门。

Scope

本主题涵盖接合菌和真菌界中非双核亚界（non-Dikarya）的其他门。它解释了接合孢子作为历史上的定义特征，该类群被基因组尺度系统发育学拆分的原因，以及相关早期分化谱系的位置。临床上值得注意的毛霉目（Mucorales）被视为主要的MeSH锚点。本条目是一个参考性概述，不提供诊断或治疗指导。

Core questions

• 什么是接合孢子？它为何定义了历史上的接合菌？
• 为何“接合菌门”作为一个自然类群被废弃？
• 如今，前接合菌是如何分布在毛霉菌门和相关门中的？
• 早期分化的真菌门与双核亚界（Dikarya）有何不同？

Key concepts

• 接合孢子
• 合胞体（大部分无隔膜）菌丝
• 孢子囊和孢囊孢子
• 毛霉目
• 毛霉菌门
• “接合菌门”的非单系性
• 早期分化（基部）真菌谱系
• 组织中宽大、带状的无隔膜菌丝

Mechanisms

经典的接合菌在两个兼容的菌丝融合时形成接合孢子，它们通常通过在孢子囊内产生的孢囊孢子进行无性繁殖；它们的菌丝宽大且大部分没有横隔膜（合胞体）。基因组尺度的系统发育分析表明，共享这些特征的类群不构成一个单一的演化支，这促使它们被重新分类到毛霉菌门和几个相关门中，而不是一个接合菌门（Spatafora et al., 2016），从而完善了Hibbett et al. (2007) 早期的高级分类方案。这些真菌宽大、稀疏分隔的菌丝使其在组织切片中呈现出独特的形态（Guarner & Brandt, 2011）。

Clinical relevance

毛霉目（Mucorales）的成员是毛霉病（mucormycosis）的病原体，这是一种侵袭性感染，其生物学特性有助于解释为何其管理被认为很困难（Katragkou et al., 2014），其特有的宽大、带状、稀疏分隔的菌丝有助于在组织病理学中识别（Guarner & Brandt, 2011）。本条目描述了使这些真菌可识别的分类和形态，并非个体诊断或治疗建议的来源。

Evidence & guidelines

前接合菌的当前分类遵循Spatafora et al. (2016) 的基因组尺度门级修订，该修订与Hibbett et al. (2007) 早期涵盖整个真菌界的方案相对照。毛霉目（Mucorales）的临床和组织病理学背景主要参考Guarner and Brandt (2011) 和Katragkou et al. (2014)。

History

在20世纪的大部分时间里，接合菌门（Zygomycota） объединяла 产生接合孢子的真菌，其中毛霉目（Mucorales）是其最著名的目。随着基于DNA的系统发育学研究的积累，该类群被证明是几个不同谱系的人工集合；Hibbett et al. (2007) 的高级分类已经指出了这种不稳定性，而Spatafora et al. (2016) 的基因组尺度分析正式用毛霉菌门（Mucoromycota）和相关门取代了“接合菌门”。

Debates

“接合菌门”是一个有效的门吗？

基因组尺度的系统发育学表明，形成接合孢子的真菌并非共享一个单一的共同祖先，因此该门被解散，其成员被重新分配到毛霉菌门和相关门中；旧的名称仍非正式地存在。

Key figures

• Joseph W. Spatafora
• Gerald L. Benny
• David Hibbett
• Jason E. Stajich

Seminal works

• spatafora-2016
• hibbett-2007

Frequently asked questions

“接合菌门”仍然是一个公认的门吗？

不。基因组尺度研究表明它并非单一的自然谱系，其成员已被重新分配到毛霉菌门和几个相关的早期分化门中，尽管“接合菌”一词仍非正式使用。

接合菌的菌丝有什么特点？

它们通常宽大且为合胞体，这意味着它们几乎没有或完全没有横隔膜（隔膜），这使得它们与双核亚界（Dikarya）规则分隔的菌丝相比，呈现出特有的宽大、带状外观。