病毒流行病学与传播
病毒流行病学与传播是研究病毒感染如何在宿主种群内部和之间发生、传播和维持的学科。它将病毒个体如何从一个宿主传播到下一个宿主的生物学过程与这些传播所产生的种群层面模式（从散发感染到流行病和大流行病）联系起来，并提供了描述和比较病毒疾病传播的定量概念。
Definition
病毒流行病学与传播是流行病学和病毒学的一个分支，关注病毒感染在人群中的分布、决定因素和动态，以及病毒在宿主之间传播的机制。
Scope
本领域汇集了描述病毒在种群层面传播的核心概念：病毒在宿主之间传播的途径、传染性相对于症状出现的时间、量化传播能力的汇总参数（如基本再生数和发病率）、种群结构和累积免疫的作用，以及流行病和大流行病的动态。它将这些概念作为病毒学和传染病流行病学中的参考概念，不提供临床或公共卫生处方。
Sub-topics
Core questions
- 特定病毒通过哪些途径从一个宿主传播到另一个宿主？
- 在感染期间，宿主何时以及多长时间能够传播病毒？
- 病毒的传播能力如何，以及如何对其传播能力进行定量总结？
- 种群结构和累积免疫如何影响疫情的增长或消退？
- 流行病和大流行病的动态有何区别？
Key concepts
- 病毒传播途径
- 传染期和潜伏期
- 基本再生数（R0）和有效再生数（Rt）
- 发病率和继发性发病率
- 群体免疫和群体免疫阈值
- 流行病和大流行病动态
- 易感-感染-康复（隔室）框架
Mechanisms
种群层面的病毒传播源于一系列个体传播事件。病毒从受感染的宿主（例如通过呼吸道飞沫、气溶胶、体液或粪便）释放，在某种介质中存活一段时间，并通过兼容的途径到达易感宿主。此类事件是否会累积形成持续传播，取决于每个病例平均产生的继发感染数量，这由再生数（reproduction number）来衡量，而再生数又反映了病毒的传播能力、传染的持续时间和时机，以及可接触的易感者数量。随着感染或疫苗接种耗尽易感人群，有效再生数（effective reproduction number）下降，从而减缓并最终逆转增长。
Clinical relevance
本领域中的概念是病毒性疾病暴发如何被发现、描述和比较的基础，它们为监测、非药物干预和免疫策略背后的推理提供了依据。在此介绍这些概念是为了解释病毒传播在种群层面的特征；它们描述的是流行病学推理，而非个体诊断或治疗决策。
Epidemiology
病毒感染的范围从持续流行的区域性疾病到爆发性流行病和全球大流行病。流感和SARS-CoV-2等呼吸道病毒说明了传播能力的范围以及症状前传染性的重要性，而对不同病原体的再生数和发病率的比较研究提供了一个共同的框架，以理解为什么有些病毒比其他病毒传播得更远、更容易。
History
传染病传播的定量研究始于20世纪早期的数学模型，并在20世纪下半叶随着隔室模型（compartmental models）和再生数框架的开发和应用而成熟。安德森（Anderson）和梅（May）1991年的综合研究巩固了种群动态方法，随后的流行病和大流行病，包括流感和SARS-CoV-2，反复检验和完善了这些工具。
Key figures
- Roy Anderson
- Robert May
- Paul Fine
Related topics
Seminal works
- anderson-may-1991
- fine-1993
Frequently asked questions
- 病毒流行病学与病毒学有何不同？
- 病毒学研究病毒的生物学及其与个体宿主的相互作用，而病毒流行病学研究病毒感染如何在人群中分布和传播；两者在传播研究中交汇，传播将个体传染性与种群层面模式联系起来。
- 哪个单一数字最能概括病毒的传播方式？
- 没有一个单一数字能涵盖所有方面，但基本再生数（R0）是衡量内在传播能力最广泛使用的总结性指标；它辅以有效再生数、发病率以及对传播途径和时间点的描述。