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时间序列ChIP-seq峰值调用 — 时间染色质谱分析
时间序列ChIP-seq峰值调用将标准的染色质免疫沉淀测序分析扩展到多个时间点采集的样本。通过在时间维度上识别和比较蛋白质-DNA结合峰值，该方法揭示了转录因子占用、组蛋白修饰或染色质重塑因子结合在分化、昼夜节律或刺激反应等生物过程中如何演变。
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来源
- Landt, S. G., Marinov, G. K., Kundaje, A., Kheradpour, P., Pauli, F., Batzoglou, S., ... & Snyder, M. (2012). ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia. Genome Research, 22(9), 1813–1831. DOI: 10.1101/gr.136184.111 ↗
- Haiminen, N., Karlebach, G., Kharchenko, P. V., & Lähdesmäki, H. (2018). TimeChIP: time-series peak calling for ChIP-seq data. Bioinformatics, 34(24), 4161–4167. link ↗
如何引用本页
ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Peak Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/zh/bioinformatics/time-series-chip-seq-peak-calling
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- ATAC-seq 分析遗传学↔ 比较
- ChIP-seq Peak Calling生物信息学↔ 比较
- 表观基因组关联研究 (EWAS)生物信息学↔ 比较
- RNA-seq差异表达生物信息学↔ 比较
- 时间序列 RNA-seq 差异表达生物信息学↔ 比较